木原均（1893年10月21日－1986年7月27日），是日本遗传学家，以小麦遗传研究闻名。
木原均于1893年10月21日出生于日本东京都。毕业于北海道帝国大学农学部，1927年至1956年任京都大学农学部教授，1955年至1969年国立遗传学研究所教授，1942年到1984年任木原生物研究所教授。他被选为日本学院的成员。
自1983年起，日本遗传学会（GSJ）将木原奖颁授给在遗传学研究领域取得重大成就的研究人员，以纪念木原均他以小麦为主的研究在全球为遗传学和演化的贡献。
1985年，横滨木原生命科学发展纪念基金会在横滨成立，以纪念木原均，促进生命科学。
当时的日本学者必须在海外工作多年才能录取为正式研究人员。在德国工作期间，木原均研究了小酸模和其他酸模物种的遗传学，并发现了性染色体。 1936 年，他注意到小麦中的七条染色体成为一对可以执行最低基因功能的染色体，因此将其命名为基因组。 基因组的概念在全世界推广，形成了生物学和基因工程发展的基础。
