王肯堂（？－1638年），字宇泰，一字损仲，号损庵，自号念西居士，金坛（今属江苏）人。 明朝官员，医学家。
王肯堂出身于官宦之家，父王樵是进士出身，官至刑部侍郎。王肯堂博览群书，因母病习医。万历十七年（1589年）中进士，选为翰林院检讨，官至福建参政。与传教士利玛窦有往来。万历二十年（1592年）因上书直言抗倭，被诬以“浮躁”降职，遂称病辞归。
王肯堂精研医理，能做眼窝边肿瘤切除手术，又能治愈疯疾。历11年编成《证治准绳》44卷，凡220万字。另著有《医镜》4卷、《新镌医论》3卷、《郁冈斋笔尘》等，辑有《古代医统正脉全书》。今人辑有《王肯堂医学全书》。
王肯堂是明末高僧紫柏真可的弟子，专攻唯识而不涉余宗，以唯识的立场，采用唯识系的经论，作为注释的依据。王肯堂著有《成唯识论证义》，在明末诸家的唯识著述中最为杰出。:195、188
