幕府（日语：幕府／ばくふ */?）是指日本历史上由征夷大将军（俗称幕府将军，简称将军）领导与统治的武家政权，为日本特有国情下所产生的的政治体制，从1185年源平合战结束时开始，至1867年明治维新时结束，历经镰仓幕府、室町幕府、江户幕府的三个幕府时期，时间总长682年。
日本有着长期军人（武家）执政的历史，军事强人以统治天下为志向，开设最高指挥机构“幕府”，类似于现代所称的军政府。征夷大将军必须由天皇任命，表面上是天皇的臣子，但大部分均为世袭，且从凌驾正规的朝廷体系后来慢慢变成正规的朝廷体系之内的一部分（公家）；由于当时日本实施封建统治，征夷大将军并不会直接掌控全国，而是会分封采邑给诸有力的武士，征夷大将军的地位则等同为天下之共主，事实上也就是用“挟天子以令诸侯”的方式治国。另一方面，由于天皇在当时的地位神圣，即使担任征夷大将军的氏族有所更迭，也没有外人敢直接篡夺天皇大位。日本这种特殊的政治体制，迥异于同时代世界上的其他国家。
中国历史时代将军出征在外，办公的府署设在帐幕，因而称为“幕府”。该词传入日本后，成为了近卫大将的汉名。之后右近卫大将源赖朝担任“征夷大将军”，因为是“大将军”，所以征夷大将军远征虾夷时的本营也称作“幕府”。战时的司令部，和平时期的政策发出地，实质上是武家政权的政府机关。江户时代中期以后，随着朱子理学的普及，研究汉学与儒学者的推广，人们把征夷大将军治事之处称做“幕府”，意义变成了政府机构。有人认为“镰仓幕府”和“室町幕府”事实上是现代用词而由后世使用；当时人们并未称呼过镰仓时代和室町时代将军府署机构为“幕府”。
源赖朝掌政时曾经设置幕府官职，赖朝所设置的官职一直流传到室町时代。
江户幕府后来改革了幕府官职。
