坐标:24°47′39″N 120°59′32″E / 24.79417°N 120.99222°E / 24.79417; 120.99222
国立清华大学物理系最初成立于1926年,为清华大学早期设立的院系之一。1955年国立清华大学于台湾新竹市复校后,1965年恢复物理系大学部。
1926年清华大学物理系成立,首任系主任为叶企孙。成立之时系内仅有叶企孙、梅贻琦两位教授,大学部两个年级共七名学生。
1937年对日抗战爆发。清华大学师生于1937年10月撤退到长沙,与北京大学、南开大学组成“国立长沙临时大学”。1938年4月又转撤到昆明,更名为“国立西南联合大学”。
1949年国共内战,国民政府撤退来台。1955年国立清华大学于新竹复校,1965年恢复物理系大学部。
1966年7月成立物理研究所,并于隔年设立博士班。
物理系馆完工于1988年,由建筑师李祖原设计。地下一层、地上七层。
1997年成立于国立清华大学,整合国内理论物理研究、促进理论研究的交流。