《神奇宝贝特别篇》（日语：ポケットモンスターSPECIAL，英语：）（简称： ポケスペ、ポケSP）是神奇宝贝漫画改编作品之一，采章节制进行。脚本编剧为日下秀宪，作画起初为真斗、后由山本智接续。目前于《CoroCoro Ichiban！》（快乐快乐一级棒！）（原隔月刊，2011年4月转为月刊）和《Sunday Webry》（网络连载）上进行同步连载。后期由于时间进度的安排及连载体系的影响，部分章节未能在连载时完结，直接以单行本出版。目前最新章节是“剑·盾篇”，全部章节加起来已经连载了600回以上。特别篇为神奇宝贝改编漫画中最受欢迎的作品，也是除了皮皮传外唯二长青的作品。
故事情节主要是跟随神奇宝贝的主线游戏（从最初的“红·绿”版开始）进行，并围绕着主角群“图鉴持有人”与神奇宝贝的冒险以及反派的阴谋。这个漫画最大特点之一，每个主角分别对应任天堂所推出电玩版本。这个代表角色不只是游戏中的登场人物，更有些（如小洛、米拉特）是《神奇宝贝特别篇》的原创角色（当然，还是以游戏登场角色为多）。随着版本增多，主角也会越来越多。
故事的每一回标题几乎都是《VS XXX（XXX是某几只神奇宝贝）》（从第三章起各章的最终决战（第八章为异次元决战）与第五章除外）。此外，故事虽然是以游戏情节为蓝本，但对于神奇宝贝的对战、世界观以及情节有着自己的表现手法，和动画、电玩的设定有不少出入。
该作曾被神奇宝贝原案田尻智推荐为“最接近其世界观”的作品，也曾被多名官方人士连续推荐。
本作于2015年推出日文版单行本数位电子版，提供读者于网络上购买阅读。后来海外代理商VIZ亦于2018年推出英文版电子版。
在第一至九集是由真斗负责作画。但因为手疾，第十集以后改由山本智接手。在衔接期间，编辑部特别安排让原本的主角（阿金、阿银）失踪。由于当时仍在第三章连载期间，所以山本智意图模仿真斗的画风而不能被一些人接受。当进入第四章红蓝宝石篇后，山本智便开始真正拿出了自己的画风。脚本则为日下秀宪。
跟在改编媒体中较为知名的动画版相较，特别篇聚焦于改编原作游戏的主要剧情，多对于战斗、冒险的描写，结构亦较为严谨。由于同样为改编原作设定，角色上也有诸多重复，但人物设定及角色个性与动画差异相当明显：例如同样以游戏主角为蓝本的小智（赤红（特别篇小智））、小遥（莎菲雅）、小光（普兰汀娜）、莎莉娜（华依）。
本作品除了在亚洲地区发行外，在欧美地区亦有发行，尽管初期在海外引进的情况还不普及，但评价普遍不错，广为各路粉丝所知，也是神奇宝贝漫画在海外市场的主要作品。
之后随着2010年电玩黑·白版的推出，美国和法国甚至于隔年抢先日本先行根据连载整理推出了黑·白篇的先行本，在两国皆有亮眼的销售量成绩。
而于2012年十一月为了庆祝特别篇的十五周年纪念，特别篇官方特地选在了法国举办签书会，吸引不少粉丝的关注，此次亦是编剧日下首次对读者公开露面。巧合的是隔年公布的神奇宝贝游戏新作“神奇宝贝X·Y版”舞台即为以法国为蓝本的“卡洛斯地区”。
随后2013年的暑假，又于日本的神奇宝贝主题商店“神奇宝贝中心”举办巡回签名会，同年的十一月，又赴往新加坡举办单日签名会。隔年2015年一月，为了庆祝第十三章“终结红宝石·初始蓝宝石篇”开始连载，于日本当时新开幕的神奇宝贝中心“百万东京”举办单日签名会。
后来于2016年三月，该系列为了纪念即将迈入二十周年，推出了以山本智为主的特别篇艺术集，并且于同期在百万东京、大阪、广岛三家神奇宝贝中心举办签名会。
《神奇宝贝特别篇》由于是根据游戏系列发行改编，因此采取“章节”制。所谓章节，即是每一章节都有属于自己的故事，且时而会有新的主角出现，但和以前的章节还是会有一定的相关性，每个角色、基本设定、感情、时间等，基本上都是相同的。虽然后期有些章节采逆时间轴进行，但基本阅读顺序跟随单行本即可。
目前《神奇宝贝特别篇》已经有了十五个章节，也有了许多主角。主角的说明，该章的首要主角会以粗体表示。
日下和山本亦曾于2006年及2008年在网络上推出过“保育家”游戏的短篇宣传漫画，分为“W任务篇”和“风涌篇”两部，主角分别为游戏中的主角风月和日向，以及创一和小瞳。此系列被视为特别篇的外传，并且于40集正式与本传作连结。后来“W任务篇”第一回被收录于2016年推出的特别篇艺术集中。
而目前保育家游戏第三作“光之轨迹”并无计划推出相关漫画。
有“*”为限定版。
