Rhizaria

有孔虫界（学名：Rhizaria）为原生生物的一条主线。它们的形态差别很大，但主要部分均为变形虫状（amoeboid）并有丝状、网状或小管型支撑的假足。它们部分会制造可能有复杂结构的外壳或骨架，而这些外壳或骨架成为绝大部分的原生动物化石。它们差不多全部都拥有管状脊的线粒体。有孔虫界分为三类：其他类别有可能被归入丝足虫类，但部分分支则较为接近有孔虫门。她们为Phytomyxea（英语：Phytomyxea）及Ascetosporea（英语：Ascetosporea），分别为植物及动物的寄生生物，与及特别的阿米巴Gromia（英语：Gromia）。有孔虫界的不同组别主要因为基因上的相似性而被认为是近亲。她们亦被认为是丝足虫类的伸延。有孔虫界的名称Rhizaria由Cavalier-Smith在2002年提出，他亦提出了Apusozoa（英语：Apusozoa）及centrohelid的名称。有孔虫界为双鞭毛生物分支的一部分，亦包含泛植物（Archaeplastida）、囊泡藻（Chromalveolata）、古虫界（Excavata）与及其他较小、未分类的组别例如无根虫门（英语：Apusozoa）（Apusozoa）及Centrohelid。和其他双鞭毛生物相同，她们均源自拥有两个鞭毛的真核异养生物（heterotrophic）。亦有想法认为有孔虫界与古虫界有与其他组别相比，在分支称为（Cabozoa）中有较深的关系。历史上很多有孔虫界的生物因为其机动性及异养性而被认为是动物。但自从五界系统（Five-kingdom system）替代动植物生物的二分法（dichotomy）成为主流后，有孔虫界被当为原生生物界。接着，卡尔·乌斯（Carl Woese）刊出其三域系统。因为无核生物界（或称为原核界，Monera）是并系群，分类学者把注意力转移在真核生物领域及原生生物（Protista）的固有并系群上。经过大量讨论后，现在讨论仍然持续，有孔虫界被归类为有效的单系群分类。