矮星系问题，也称为卫星星系失踪问题，源自数值宇宙论模拟预测宇宙中的物质分布的发展。暗物质似乎是越来越多，且越来越小的晕的统治阶层。然而，观察到的正常大小的星系，作为其卫星星系的矮星系却是远低于模拟的数量级。 。相较之下，在本星系群观察到的38个矮星系中，只有11个是环绕着银河系旋转（详细的资料和更多最新的清单请参见银河系的卫星星系），然而暗物质的模拟预测银河系要有500个矮星系的卫星星系。
这个问题有两个可能的解决方案。一个是小晕确实存在，但因为不能吸引到足够的重子物质，最终只有很少的部分成为可见的矮星系。凯克的观测支持此一观点：凯克天文台在2007年的观测报告显示，有6个新发现的超暗弱的银河系卫星矮星系，都被99%的暗物质环绕着（质光比大约是1000）。另一个解决方案是矮星系往往会因为潮汐的剥离或复杂的交互作用而合并至较大的星系。潮汐剥离已经被安排在解决矮星系问题的第一顺位，但这是极其困难的任务。因为这些物件具有低表面亮度和高散度，以至于它们都难以被察觉。
