伊斯兰教，是阿萨姆邦其中一种主要宗教，穆斯林占全邦人口34%。伊斯兰教在13世纪时引入，而当地的孟加拉语穆斯林则是英国殖民时代来到。
穆斯林最早是在13世纪早期来到阿萨姆地区，一位突厥将军穆罕默德·本·巴克蒂亚尔·哈尔吉在1205年进入东印度，一位梅奇人酋长在哈尔吉遨请下接受伊斯兰教，改名阿里·梅奇，后来成为哈尔吉进军迦摩缕波的向导。随着13世纪初苏菲沙阿·贾拉勒及其弟子的到来，伊斯兰教在巴拉克山谷得到了普及。大部分山谷都被孟加拉苏丹国控制。从那时起，穆斯林继续在阿萨姆各行各处发挥重要作用。
1613年，莫卧儿帝国吞并阿萨姆邦西部的库齐·哈乔并统治戈阿帕拉，但不能征服阿萨姆邦的其他部分。一些莫卧儿帝国士兵成为阿豪姆王国的俘虏，他们后来被当地居民同化但仍保持伊斯兰教信仰。
在1630年，一位穆斯林圣徒沙赫·米兰从巴格达来到阿萨姆传播伊斯兰教，因此许多人已进入伊斯兰教的怀抱，并成为他的弟子。他的陵寝位于现在的西布萨加尔区。
虽然阿萨姆邦的穆斯林没真正的种姓区分，但仍因来源不同可分为三类:
英国东印度公司在1757年普拉西战役后确立了英国在孟加拉地区的统治，阿萨姆也遭到殖民统治。英国人带来了一些孟加拉定居者，而这些孟加拉人也鼓励其他孟加拉人定居在阿萨姆邦。阿萨姆邦的肥沃土地吸引了一批来自东孟加拉的失地农民，而英国人在当地开设茶园，也欢迎他们来到。
阿萨姆邦有相当数量的本土穆斯林，但邻国孟加拉穆斯林非法移民数字的急剧上升引起阿萨姆人的担忧。
对孟加拉国穆斯林的人口侵略的恐惧在阿萨姆邦一直是个政治问题，在1983年大约2000个孟加拉语穆斯林在种族冲突中被杀。
在2001年，阿萨姆有6个穆斯林占多数的地区，10年后已增加到9个区。
阿萨姆穆斯林很可能是整个亚洲中最正统的穆斯林社区之一。但他们仍遵循许多印度教的习俗，参加印度教节日。
大多数阿萨姆穆斯林也是农民。
Assam: Religion and Caste". Government of Assam. Retrieved 28 August 2015.
