威廉三世（1375年－1435年9月12日；German: ），维特尔斯巴赫家族成员，巴伐利亚-慕尼黑公爵（1397年—1435年在位）。巴伐利亚-慕尼黑公爵约翰二世与第一任妻子戈里齐亚的凯瑟琳（英语：Catherine of Gorizia）的次子。
威廉三世于慕尼黑出生。1397年，父亲约翰二世逝世后，与他的兄长恩斯特一起统治了巴伐利亚-慕尼黑公国。
威廉三世与兄长恩斯特于1396和1410年锁压了慕尼黑市民的起义，并迫使他的伯父斯特凡三世于1402年将他的统治范围限制在巴伐利亚-因戈尔施塔特。随后，威廉三世与恩斯特仍然成功地与巴伐利亚-因戈尔施塔特的斯特凡三世和他的儿子（大胡子）路易七世进行数次的战斗，并成功获胜，他们亦成为巴伐利亚-兰茨胡特公爵亨利十六世的盟友。
施特劳宾-荷兰的维特尔斯巴赫家族断绝后，恩斯特和他的弟弟威廉三世与堂兄弟巴伐利亚-兰茨胡特公爵亨利十六世和巴伐利亚-因戈尔施塔特公爵路易七世战斗而争夺其遗下的领地，但最终于1429年获得巴伐利亚-施特劳宾的一半，包括施特劳宾。
作为卢森堡王朝的盟友，恩斯特支持他被废黜的妹夫文策尔一世反对自己的维特尔斯巴赫王朝旁支的新任国王鲁普雷希特以及瓦特斯劳斯的弟弟西吉斯蒙德，但是威廉三世支持西吉斯蒙德，二人一起于1419年/20年进军波希米亚及其对扬·胡斯的支持者战斗，由此开始了胡斯战争，随后巴伐利亚被拉进战争。由于胡斯党人的威胁，慕尼黑将原有的城市防御工事在1429年通过第二个外墙环得以加强。
从1431年起，威廉三世为西吉斯蒙德主办巴塞尔宗教会议 。因此，他确保神圣罗马帝国的和平，增强巴塞尔会议的权威，并能够在巴塞尔会议和胡斯党人之间成功进行谈判，其结果是于1433年签订巴塞尔契约（英语：Compacts of Basel），从而结束胡斯战争。许多人觉得威廉三世是一位熟练的外交官，并将他视为年老的罗马人民的国王西吉斯蒙德的接班人，但他却早于1435年去世。
威廉三世与其妻子克莱沃的玛格丽特（英语：Margaret of Cleves, Duchess of Bavaria-Munich）的儿子是巴伐利亚公爵阿道夫，阿道夫在威廉三世逝世后接替他成为伯父恩斯特的摄政，直到他于1441年去世。威廉三世被埋葬在慕尼黑圣母主教座堂。
威廉三世于1433年5月11日在巴塞尔与克莱沃公爵阿道夫一世（英语：Adolph I, Duke of Cleves）的女儿克莱沃的玛格丽特（英语：Margaret of Cleves, Duchess of Bavaria-Munich），并育有以下子女：
