吕惠卿（1032年－1111年），字吉甫，号恩祖。闽南晋江人（今福建泉州），北宋大臣，曾任参知政事，是北宋新旧党争中的新党人物。著述甚丰，有《文集》、《孝经传》、《道德经注》、《论语义》、《庄子解》等书。
吕惠卿生于仁宗明道元年（1032年），晋江县开建乡仁孝里西垵村（今属福建省晋江市安海镇）。吕惠卿幼年随父亲吕璹居住于泉州相公巷。
仁宗嘉祐二年（1057年）进士，历仕仁宗、英宗、神宗、哲宗、徽宗五朝，受到欧阳修、曾公亮、王安石等人的赏识。精明贤能，不畏权贵，极力推行变法，是“熙宁变法”的第二把交椅。神宗熙宁二年（1069年）与司马光展开了辩论，以汉朝的制度沿革，驳倒司马光，取得重大胜利。
熙宁七年（1074年），王安石第一次罢相。吕惠卿临危受命，出任参知政事。吕惠卿在推行新法的同时，又与王安石子王雱同修《三经新义》。王安石称：“惠卿之贤，岂特今人，虽前世儒者，未易比也。学先王之道而能用者，独惠卿而已。”但他强迫百姓借贷青苖钱，又借故打击其他改革派官员。熙宁八年（1075年），邓绾等人攻击吕惠卿，吕惠卿罢政，在太原期间，整顿西北军，多次抵抗西夏的入侵。徽宗时，又受到蔡京等排挤。政和元年（1111年），以观文殿学士、光禄大夫辞官归里，不久病死。
列《宋史·奸臣传》的主要原因是缘王安石得进，后来又与安石为了拜相，产生过节，不得已方自引退（王安石二次拜相时，吕惠卿从中阻挠，王安石不动声色，接旨上任，令吕惠卿措手不及），为士大夫所诟病。
