PAUP

✍ dations ◷ 2024-12-24 09:15:59 #计算系统发生学,生物信息学软件

PAUP*是自从2000年左右以来使用最广泛的种系发生演算软件包。由于其独特的命名方式(读作Paup Star),也常常被“误称”为PAUP。PAUP是Phylogenetic Analysis Using Parsimony的缩写。PAUP*是一个收费的软件。

美国佛罗里达州立大学的David Swofford。

PAUP*最开始只是为苹果Macintosh系统设计。后来被移植到Windows平台。截至2006年11月为止,完整的用户界面也只能在Mac OS 9和Mac OS X的Classic环境下运行。Windows版本有一个简单的用户界面。而portable版本,即设计给Unix/Linux系统使用的版本,只有命令行字符界面。根据作者David Swofford 2006年5月在美国亚利桑那州的坦佩召开的GEB2006(Genomics, Evolution and Bioinformatics 2006)会议上的报告,为Windows和Mac OS X所设计的完整用户界面正在开发中,预计2006年内会发布。但是截至2008年11月,新版本都还没有发布出来。目前使用Intel处理器的苹果计算机可以联系销售商,下载portable版本。

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