恩克巴雅尔（1902年8月－1928年7月）蒙古族，内蒙古乌拉特前旗阿拉塔庆苏木（今巴音花镇）人，内蒙古人民革命党中央执行委员。
1902年8月，恩克巴雅尔生于内蒙古乌拉特前旗阿拉塔庆苏木的一个贫苦牧民家庭。13岁时，恩克巴雅尔考取乌拉特西公旗衙门见习文书。1919年初，恩克巴雅尔随旗扎萨克赴北京蒙藏院任职。在蒙藏院任职期间，恩克巴雅尔受到俄国十月革命及中国早期马克思主义者影响。1920年秋、1924年冬，恩克巴雅尔先后两次赴外蒙古及苏联学习考察。1921年归国后，恩克巴雅尔在乌拉特草原创建“红党”，这是一个宣传革命思想的群众团体，恩克巴雅尔由此成为内蒙古西部首位宣传马列主义的先驱。1925年，内蒙古人民革命党成立后，恩克巴雅尔率“红党”加入内蒙古人民革命党，当选为内蒙古人民革命党中央执行委员。1926年秋，恩克巴雅尔参与创建内蒙古人民革命军，并亲自领导内蒙古人民革命军。
1927年，蒋介石发动四一二政变后，蒙旗上层人士投靠蒋介石，并多次围攻内蒙古人民革命军。恩克巴雅尔为保存力量，于1928年7月率部向外蒙古转移，途中遭到阻击，抵达中旗恩格尔庙休息时，遭到中旗保安团包围，恩克巴雅尔中弹阵亡，享年27岁。
中华人民共和国成立后，恩克巴雅尔被追认为革命烈士。
