马来西亚－尼日利亚关系是指马来西亚与非洲国家尼日利亚间的历史双边关系与现代双边关系。马来西亚于尼日利亚成立之初即给予外交承认，两国又在1965年3月建立大使级外交关系。马来西亚也是最早与尼日利亚建立邦交的亚洲国家之一。建交以来两国邦谊持续加深，各领域来往不断。现今两国也通过在联合国、英联邦、不结盟运动、77国集团等多个国际组织的合作交流加深了邦谊。
马来西亚、尼日利亚两国均曾经是大英帝国的殖民地，直到各自于1957年、1960年独立，并加入了大英国协。尼日利亚独立后，马来西亚首任首相东姑阿都拉曼立即向尼日利亚民众表达祝贺，并宣布马来西亚政府承认尼日利亚。东姑阿都拉曼与尼日利亚总理兼外交部长阿布巴卡尔·塔法瓦·巴勒瓦交情也非常密切，在印尼－马来西亚对抗期间，尼日利亚政府更在道义上支持马来西亚，谴责印尼。随后两国亦于1965年3月3日建立邦交，大马政府也立即在尼日利亚首都拉各斯建立了大使馆层级的高级专员公署。此后双边关系友好顺利发展，并在联合国、英联邦、不结盟运动、77国集团等多个国际组织相互支持。
尼日利亚幅员辽阔、人口众多，具有一定的经贸潜力。两国早在独立之初就已经建立经贸联系，并在树胶、棕油等产业上交流不断。又建立了马来西亚－尼日利亚商会，以促进贸易往来。据经济复杂性研究中心统计，2020年，两国贸易总额达到9.48亿美元。其中马来西亚对尼日利亚出口额为7.29亿美元，同比2019年增长了3.26%，主要出口棕榈油及石油制品，尼日利亚也是马来西亚在非洲第一大出口伙伴。尼日利亚对大马出口2.19亿美元，同比2019年增长了3.54%，主要出口原油、锡、铝土及可可豆等。
在20世纪70年代，石油资源丰富的尼日利亚开始受到大马政府及商人的青睐，其后又有马来西亚华人前往拉各斯经商。进入21世纪以来，马来西亚加强了对包括尼日利亚在内的非洲诸国之投资，马来西亚籍企业也在尼日利亚的石油产业、建筑业等领域多有建树。
自马来西亚驻尼日利亚高级专员公署于1965年建立以来，就积极协助马来西亚与尼日利亚加强文化联系，并在尼日利亚推广本国电影及其他马来西亚文化。在教育领域，自马哈迪出任大马首相以来，双边教育领域之交流得到了一定的加强。马来西亚政府、对外贸易发展局不仅与日本等国政府一同开展第三国培训计划，为尼日利亚政府官员提供培训。也通过MTCP计划努力扩大对包括尼日利亚在内的非洲国家之援助规模。马来西亚教育部则与一些招生机构合作，在尼日利亚展开招生宣传，以吸引该国学生前往马来西亚的高等院校深造。现今，英文普及度较高、生活品质较好的马来西亚已经成为尼日利亚人留学、工作的重要目的地国之一。尼日利亚留学生也容易取得大马签证从而入境马来西亚。惟马来西亚主流社会排斥包括尼日利亚人在内的黑人新住民。加之一些尼日利亚人参加犯罪组织，对马来西亚的城市管理和治安造成困扰，也引起了一定的关注。
