《哥斯拉×美加基拉斯 G消灭作战》（日语：ゴジラ×メガギラス G消滅作戦），2000年上映的日本电影，哥斯拉系列电影的第24集，东宝电影公司制作、发行，日本票房收入12亿日圆，观众人次约135万。导演手冢昌明曾担任《摩斯拉2 海底大决战》及《摩斯拉3 王者基多拉来袭》的副导演，本片是他首次担任导演的作品。
1954年，经由核子试爆诞生的魔兽-哥斯拉在东京上陆，二次大战后重新繁荣的首都一夜之间再度化为灰烬。由于东京被严重破坏于是日本政府迁都大阪，新日本又重新振作。
1966年日本第一个核电厂东海村电厂被哥斯拉破坏，日本政府乃永决定放弃核能发电。之后政府努力开发不会吸引哥斯拉的新能源，但无论是风、水还是太阳能都无法满足经济发展的需要。终于在1996年开发出干净的新能源:“等离子动力发电”。但是在大阪的电厂运作不久，哥斯拉再次出现破坏了新电厂，而自卫队特殊部队也在大版的街道上与哥斯拉展开一场肉搏战，最后除辻森桐子、奥村知治两名队员外其余全部罹难。
现在，2001年，日本政府成立特别G对策本部，打算对哥斯拉实行把它吸入微型人工黑洞的“G消灭作战”。但难处是必须将产生黑洞的仪器缩小到两米以内以装在人造卫星上发射，于是对G战斗部队“G抓住”的队长辻森桐子找到了在秋叶原开店的天才微机械科学家工藤元。
工藤与他的老师-MBH炮开发的责任者吉泽佳乃合作，完成了黑洞炮并在山梨县白州试验。但由于实验失误造成时空扭曲，史前昆虫美加努拉穿越洞口来到现代。目击实验的小学生早坂淳在试验场附近发现一颗不祥的卵。在搬到东京以后，他把卵丢在涉谷附近的排水沟里。
卵孵化出了许多幼虫-美加努隆，攻击人群并破坏地下水脉，造成涉谷大淹水形成涉谷湖。完成发射至太空之后的黑洞炮命名为“次元潮”，特G对在奇岩岛实施哥斯拉诱导作战，然而成群的美加努隆脱皮长成美加努拉斯飞往奇岩岛欲吸收哥斯拉的能量，干扰了次元潮的瞄准，哥斯拉于是跟数以万计的美加努拉斯展开苦战，最后用热线击退了它们，特G对见机不可失趁势发射黑洞炮，但因没有手动微调而功败垂成，哥斯拉再度回到海上。
生还的美加努拉斯则回到涉谷湖里将哥斯拉的能量注入湖底沉睡的一只巨大的美加努隆身上，接受了哥斯拉的能量，美加努隆脱皮，究极的战斗体“美加基拉斯”诞生!!它在破坏涉谷及周边后飞得无影无踪。
奇岩岛离开的哥斯拉证实向东京方面游来，由于东京没有电厂等能源为何哥斯拉会游过来?桐子抱持着不解。哥斯拉在台场上陆，特G对出动“格利分”战机以光子炮迎击，在双方战斗同时，美加基拉斯飞来，它觊觎哥斯拉丰沛的能源故与哥斯拉展开死斗，在一阵摔角般的决斗之后，哥斯拉辛苦地获胜了。 在哥斯拉与美加基拉斯战斗的同时，特G对一度想发射黑洞炮将两只怪兽送入黑洞，不过受美加基拉斯发出的高周波破坏，黑洞炮故障而次元潮卫星也向地面落下。
打败敌人后哥斯拉走向国立理化学研究所展开破坏，G对策本部长杉浦基彦才说出原本在5年前就应该被废止的等离子动力能源研究一直都还在秘密进行…桐子听得非常生气向长官挥拳。之后她独自一人驾驶格利分升空欲引导即将坠落的次元潮发射…，格利分冲向哥斯拉，桐子在千钧一发之际跳伞，瞬间黑洞炮发射，哥斯拉消灭!
数个月后，桐子又出现在工藤面前，告知东京地下出现移动震源。早阪淳回到山梨县乡下，突然地震，哥斯拉的咆哮声再次出现…
