乔弗雷·波吉亚（意大利语：Gioffre Borgia，加泰罗尼亚语：Jofré Borja，也叫做 Goffredo；1482年－1518年)，出生于意大利罗马，是教宗亚历山大六世与他的情妇瓦诺莎·卡塔内所生的第4个，同时也是最小的孩子，他另外3个兄弟姊妹分别是兄长切萨雷·波吉亚、乔凡尼·波吉亚以及姐姐卢克雷齐亚·波吉亚。
乔弗雷于1494年他12岁时娶了那不勒斯的阿方索二世之女阿拉贡的珊莎为妻，珊莎比乔弗雷大4岁，他们年轻的爱情也成为了许多艺术作品的题材。
因着与珊莎的婚姻，1494年珊莎获得了斯奎拉切公国作为嫁妆，也让她与丈夫获得了斯奎拉切亲王与亲王妃的称号，在那不勒斯经过了一段动荡的政治情势后，他们也于1497年获得了阿尔维托(Duchy of Alvito)。
事实上这段婚姻完全是出自政治动机，阿方索二世把女儿嫁给乔弗雷并使他获得大量的嫁妆是为了让亚历山大六世承认他对那不勒斯的统治权，但就在婚礼结束后不久，情势就因法国国王查理八世入侵意大利并宣称对那不勒斯有着统治权而有所改变。阿方索二世随后死去并把王位给了他短命的儿子斐迪南二世，之后西班牙、意大利、法国的战争便持续了很长一段时间。
在这期间年轻的情侣居便居住在罗马。珊莎据说与乔弗雷的两个哥哥乔凡尼跟切萨雷有婚外情，这恶化了他们的婚姻关系，也因此他们并没有小孩。
乔弗雷与他的父亲教宗亚历山大六世的关系是很薄弱的，教宗认为他是个懦弱的人，因为他缺乏对政治的兴趣以及抱负，教宗甚至曾经公开质疑过他是否非他所出。
但即使如此1497年教宗仍公开澄清他绝不是杀害他哥哥乔凡尼的凶手，因为大部分的证据皆指向凶手是他的另一个哥哥切萨雷，因为切萨雷与乔凡尼的公开对立以及两人皆周旋于乔弗雷的妻子珊莎之间，因此众人皆认为切萨雷才是杀害乔凡尼的凶手。
乔弗雷与他的姐姐卢克雷齐亚·波吉亚的关系似乎不错，因为他曾短暂的帮助过她治理斯波莱托。
在1499-1504年法国国王路易十二征服那不勒斯的战争中，乔弗雷是站在法军这边的，但当他被佣兵队长普罗斯佩罗·科隆纳（英语：Prospero Colonna）捕获后，他改变了立场，加入了西班牙军，这导致了他的领地，阿尔维托的叛变。1504年，他挪用在1503年向教皇国国库拿的钱派遣雇佣兵首领法布里奇奥·科隆纳（英语：Fabrizio Colonna）率兵去平定他领地的叛乱，随着叛军的溃败，他终于于1504年前往他在阿尔维托跟斯奎拉切的领地。
但两年后珊莎去世，乔弗雷失去对阿尔维托统治的权力，因为领地被时任西班牙兼那不勒斯国王阿拉贡的斐迪南二世收回，但他获准得以那不勒斯封建附庸的名义，保有对斯奎拉切的统治权。
乔弗雷的第二段婚姻娶了玛莉亚·德·米拉（Maria de Mila），玛丽亚是他的表亲，他们共有4个孩子，分别名为弗朗切斯科（Francesco）、卢克雷齐亚（Lucrezia）、安东尼雅（Antonia）和玛丽娜（Marina），而他的长子弗朗切斯科·波吉亚在他死后继承了斯奎拉切大公的称号。
乔弗雷的后代持续统治斯奎拉切直到1735年，但他的后代们都是借由执政官来代为统治，因为他们通常住在那不勒斯或西班牙的王宫中。
