2016年NBA选秀在2016年6月23日在纽约布鲁克林区的巴克莱中心举行。届时，ESPN将向全美直播。
本次选秀是基于2011年联盟与球员工会达成的新劳资协议（Collective Bargaining Agreement，CBA）制定的规则下进行。在2011年停摆时期，该CBA的制定并没有立即修改选秀规则，不过该协议呼吁球员工会与联盟管理层建立一个委员会以商讨未来选秀可能发生的变化。本次选秀的基本资格规则如下所示。
所有参加本次选秀的球员必须在2015年至少年满19岁，也就是那名球员必须在1996年12月31日或更早的时候出生。只要不符合CBA规定的“国际球员”定义的球员，就至少要在那名球员高中毕业之后一年才可以参加选秀。但如果这名球员在美国外的任意国家居住超过三年，并拥有该地的永久居留权，并且没有完成在美国的高中学业且就读的大学不在美国或没有进入大学者，就被CBA定义为“国际球员”。
今年的选秀中有48名大学弃学球员和43名国际球员在4月26日的截止日之前参选。在6月15日的退选截止日前，32名国际球员和一名大学弃学球员（杰罗姆·希尔）退选，仍有47名大学弃学球员和11名国际球员参选。
选秀的前14个签位归属于未能进入2016年NBA季后赛的球队；它们之间的选秀顺序是根据乐透抽签决定。乐透抽签会决定首轮前三个选秀名额的分配，首轮其他顺位以及第二轮选秀顺序都是按照前一个赛季中各队胜负记录逆序分配。
选秀的抽签仪式于2016年5月17日举行。拥有上赛季最差战绩和最大状元签概率的费城76人抽中状元签，洛杉矶湖人以第二大的状元签几率抽中第二顺位，而布鲁克林篮网（交易至波士顿凯尔特人）则将拥有第三顺位。
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