藤原赖长（1120年（保安元年）5月－1156年8月1日（保元元年7月14日））是日本平安时代末期的公卿。出身藤原北家，是藤原忠实的次子。绰号恶左府或宇治恶左府。
幼名菖蒲若，其父藤原忠实担任摄政、关白、太政大臣的职务。1130年元服后叙正五位下的官位（日语：官位），任侍从、近卫少将和伊予权守。此后凭借父亲的关系，赖长的官位昇进很快，1149年（久安5年）叙从一位左大臣的官位。
藤原赖长博学多识，精通儒学，而且擅长于和歌和汉诗的创作。其性格苛烈、待人严厉而且拒绝妥协，因此得到了“恶左府”的绰号。赖长有一女名多子，嫁给近卫天皇为皇后。
1155年，近卫天皇逝世。鸟羽法皇本希望让崇德上皇的儿子重仁亲王继位，但遭关白藤原忠通（赖长的兄长）反对，认为雅仁亲王的长子守仁亲王有作为国君的才能，因此改立雅仁亲王即位，是为后白河天皇。崇德天皇十分怨恨，暗中拉拢藤原赖长同后白河天皇一派对抗。
次年，鸟羽法皇驾崩，两派的冲突白热化。京都风传赖长勾结崇德上皇谋反，因此，后白河天皇下令没收藤原赖长拥有的庄园。当时，没收庄园意味着被定为谋反之罪，赖长以此为理由举兵，拥立崇德上皇讨伐后白河天皇。7月8日，赖长纠集属下武士平家弘（日语：平家弘）、源为义、平忠正等人据白河北殿（崇德上皇的住所）开军事会议，源为朝建议夜袭高松殿，但被赖长拒绝，决定等待兴福寺僧兵的支援。后白河天皇则在11日黎明袭击白河北殿，崇德上皇方面宣告失败。赖长由家司藤原成隆（日语：藤原成隆）抱持着骑马逃出御所，途中为源重贞（日语：源重貞）放箭射伤了头部。赖长受了重伤，抱着最后的希望逃亡奈良，向已退隐的父亲藤原忠实求救，遭到拒绝，失意而死。
赖长死后，其长子兼长（日语：藤原兼長）、次子师长（日语：藤原師長）、三子隆长（日语：藤原隆長）、四子范长皆遭流放。除了师长之外皆死于配流之所。
保元之乱之后，藤原赖长被封为朝敌。1164年，其次子藤原师长（日语：藤原師長）受到特赦，回到京都（平清盛执政后，师长成为太政大臣）。然而1177年（安元3年）先后发生延历寺强诉事件、安元大火和鹿谷阴谋事件，朝廷认为是赞岐院（崇德上皇）和藤原赖长的怨灵作祟，因此在8月3日谥赞岐院为崇德天皇，同时追赠藤原赖长正一位太政大臣的官位。
