在日菲律宾人（日语：在日フィリピン人、菲律宾语：Mga Pilipino sa Hapon），指的是居住于日本的菲律宾人，是日本第三大外国人群体，截至2015年尾为止人口有224,048人。
根据日本法务省纪录，1998年时在日菲律宾人的人口有245,518，但因在2000年日本开始打击人口贩运而回落至144,871人。日本人与菲律宾人通婚是在日本的所有国际婚姻中最常见。截至2011年3月12日的统计，在日菲律宾人口为305,972人。
根据菲律宾中央银行公布的数字，海外菲律宾工人在1990年-1999年之间从日本汇回超过1亿美元的收入。虽然大多数的菲律宾人在日本是短期的居民，他们因国内疲弱经济到日本谋生，而一些在日菲律宾人则是留学生，和日本人非婚生没居留权或国籍的混血儿。
