滤齿翼龙属（属名：）是翼龙目梳颌翼龙科的一属，生存于白垩纪早期的东亚，是热河生物群发现的第五个梳颌翼龙类物种。
正模标本（编号IVPP V12339）发现于中国辽宁省西部，属于义县组下层的尖山沟层，地质年代约1亿2500万年前，相当于阿普第阶早期。化石是一个关节脱落的头颅骨、下颌枝部位、以及前两节颈椎。
在2011年，中国科学院古脊椎与古人类研究所的蒋顺兴、汪筱林将这个化石叙述、命名。目前本属为单型属，模式种是邱氏滤齿翼龙（），属名是由古希腊文的“翼”（）与拉丁文的“过滤器”（）所构成，意指它们的齿列；种名则是以古生物学家邱占祥为名。
滤齿翼龙的头颅骨非常长，长20.8公分。头颅骨外形平顺、侧面的中段稍微下凹、头颅骨上侧缺乏骨质头冠。下颌也很长，中央没有隆脊
蒋顺兴、汪筱林列出五个滤齿翼龙的可鉴定特征。牙齿总数约达112颗。头颅骨的前面58%部分具有牙齿。前段牙齿长度不一。下颌联合处的长度约为下颌的58%长。下颌联合处的下侧有个低槽。最后两个属于自衍征。
滤齿翼龙的牙齿长、呈尖状。前段牙齿最大型、牙齿朝向前方；越后段牙齿越小、牙齿逐渐朝向两侧。当嘴巴咬合时，上下颌的牙齿会啮合，而上颌前段的长牙会突出于下颌前端。牙齿间隔相当一致。上颌每边有29颗牙齿，第二、第五颗牙齿最长。下颌长17.4公分，每边约有27颗牙齿。
蒋顺兴、汪筱林在命名滤齿翼龙时，将它们归类于始翼手龙超科（Archaeopterodactyloidea）的梳颌翼龙科。
