软骨硬鳞亚纲（学名：Chondrostei）又名软质亚纲，为脊索动物门辐鳍鱼纲的一个亚纲，是辐鳍鱼纲的基群，保留了辐鳍鱼类一些原始的祖征，如软骨脊索等。
软骨硬鳞鱼类具有骨质脑颅，但大部分是软骨质组成。上颌骨与前鳃盖骨、下眶骨固结，几乎不能活动。尾鳍为歪型或半歪型。体侧有板质硬鳞。
在不同的分类系统中，这一演化支也被称为软质总目、硬鳞总目。
本亚纲包括比耶鱼目以及鲟形目等等。传统分类将多鳍鱼目（Polypteriformes）归类于此，但本亚纲因而成为并系群，于是新的分类将多鳍鱼一支独立为腕鳍鱼纲，使本纲成为有效的单系群。新鳍亚纲是本亚纲的旁系群。
本亚纲大部分种类已经灭绝（以†标示）；目前仅存鲟形目。
依照2017年《硬骨鱼支序分类法》，本亚纲与其它硬骨鱼的演化关系如下：
真骨下纲 Teleostei 
全骨下纲 Holostei 
软质亚纲 Chondroste 
腕鳍鱼纲 Cladistia 
肺鱼纲 Dipnomorpha 
四足形上纲 Tetrapodomorpha 
腔棘鱼纲 Coelacanthimorpha 
软骨鱼纲 Chondrichthyes 
（外类群）
