肉鳍鱼总纲（学名：Sarcopterygii）是硬骨鱼类的一个演化支。此类鱼的特点是鱼鳍中有一个中轴骨，在前鳍的基部上有明显的肌肉组织与分开的两片腹鳍，和之后两栖动物和四足类动物的演化有直接的关联性。此总纲之下包括腔棘鱼纲及肺鱼四足纲。
肉鳍鱼最早出现在距今4.23亿年前的志留纪的晚期。大部分于距今6500万年前的晚白垩纪灭绝。其中的腔棘鱼曾被认为完全灭绝，直到1938年才在非洲东南海域深海捕捉到活体，之后并在印度等地区多次被发现而证实仍然存活于深海中。目前仅存一目二种，即矛尾鱼，被认为是鱼类中的活化石。
大多数肉鳍鱼已绝种，目前已知体型最大的肉鳍鱼为石炭纪时期苏格兰的希氏根齿鱼，体长可超过7米（23英尺）。现存两群腔棘鱼纲及肺鱼亚纲中，体型最大的腔棘鱼为西印度洋矛尾鱼，体长可达2米（6英尺7英寸），体重可达110千克（240磅）；体型最大的肺鱼为非洲肺鱼科，体长同样可达2米（6英尺7英寸），重量可以达到50千克（110磅）。
现有研究表明，包括人类在内的陆生脊椎动物（即四足动物）有可能是在大约3.6亿年前从肉鳍鱼类中的蝶柱鱼演化而来。
腔棘鱼纲分为腔棘目和爪齿鱼目。其中爪齿鱼目生活在四亿年前左右，已灭绝。现仅存腔棘目下矛尾鱼，被称为“活化石”。
肺鱼四足纲（Dipnotetrapodomorpha）除了包含现存的肺鱼亚纲和四足形亚纲两，也包含史前的爪齿鱼类，而扇鳍纲则是个只包含前两者的泛群、但不包含爪齿鱼类。肺鱼四足纲与扇鳍类的关系取决于爪齿鱼类的地位，如果爪齿鱼类较接近肺鱼四足类而不是棘腔鱼纲，则扇鳍类为肺鱼四足类子类；如果爪齿鱼类不属于这里，则肺鱼四足纲可能成为扇鳍纲的异名：
依照2017年《硬骨鱼支序分类法》，本总纲与其它现生硬骨鱼的演化关系如下：
真骨下纲 Teleostei 
全骨下纲 Holostei 
软质亚纲 Chondroste 
腕鳍鱼纲 Cladistia 
肺鱼亚纲 Dipnomorpha 
四足形亚纲 Tetrapodomorpha 
腔棘鱼纲 Coelacanthimorpha 
软骨鱼纲 Chondrichthyes 
（外类群）
