基督科学教会（Christian Science），亦译为基督教科学会、基督教科学派，1879年由玛丽·贝克·艾迪创立，总教堂（或称母教堂）位于美国马萨诸塞州波士顿。此教派的教义主要来自她所著的《科学与健康暨解经之钥》。
艾迪宣称，既然上帝是绝对的善与完美，那么罪、疾病和死亡都与上帝无关，因此都不是真实的。这个物质世界是虚幻的，真正的真理和存在都是在精神层面上，所以所有的物质上的“错误”都可以靠更高层次的灵修来解决。她更进一步地说明她所领悟出来的道理正是如同《圣经》里所记载的那样，耶稣基督有治愈能力也是因为有同样的领悟。基督科学教徒（或基督科学者）则根据这个教义深信，疾病可以透过信仰、祈祷和领悟更高一层对于上帝、基督与人之间的关系而治愈。这样的结果就是教徒有病痛时往往只靠着祈祷而不寻求医疗协助，他们的教会刊物上也常常刊登这类的透过祈祷而治愈的报导。
基督科学教会非传统的传教方式和内容因此引起许多争议。一些教会人士因为不肯寻求正常的医疗协助，只靠着祈祷来治病，结果死于一些本来可以医好的疾病。其中因此而死的小孩，他们的父母因此被提起刑事诉讼，理由是疏忽和不当致死。教会方面则辩称，根据他们的完整纪录，他们的“灵修治病”祈祷方式确实治愈了许多连医生都束手无策的绝症。
在神学界，基督科学教会的教义也引起一阵骚动，特别是透过19世纪起盛行的科学角度来看（注：也就是基督科学所称的“科学”完全称不上科学）。一些其他基督教派人士则讥讽，基督科学教会只能算是一种《圣经》解说学派，只是一时的，根本不算是一种新的基督教派。即便如此，基督科学教会在发展初期以及在1960和1970年代的再次发展却也因此吸引很多人的注意，也得到了快速的成长。
在分类上，基督科学教会通常被归类到基督教分支的复原教派这一旁支上，不过也引起一些争议。
