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基因型分型
✍ dations ◷ 2025-06-08 12:11:21 #基因型分型
基因型分型(英语:genotyping)是一个通过生物检定法检测某一个体的DNA序列,并对比参照其他个体的基因型或序列的过程,可用于显示该个体等位基因从其父母遗传而来的情况. 通常,基因型分型利用DNA序列定义群体信息,而不涉及定义该个体的基因。目前的基因型分型方法包括限制性片段长度多态性识别法(英语:restriction fragment length polymorphism)(RFLPI)、多态随机扩增检测法(RAPD)、扩增片段长度多态性识别法(AFLPD)、聚合酶链式反应(PCR)、DNA测序、等位基因专有低核苷酸探针检测法探针检测法(英文:allele specific oligonucleotide (ASO) probes)以及基因微阵列混合法。基因型分型对于研究与疾病相关的基因和基因变体极其重要。但囿于目前技术,几乎所有的基因型分型都只能部分完成,每个个体仅有一小部分的基因型被分型。新的大规模DNA测序技术 保证未来我们可以获得全基因组基因分型。基因型分型广泛用微生物。例如病毒与细菌 均可被基因型分型,由此我们通常可以追溯疾病暴发的源头,以更好的控制病原体的传播。 此领域常被命名为分子流行病学,并与法医学与微生物学息息相关。对于人类的基因型分型亦有重要意义,例如,如需追溯某个体的遗传学父亲或母亲,只需十至二十段基因组区间即可(如单核苷酸多态性,英语:SNP)。相比于人类全基因组多达三十亿的核苷酸,这是极小的一部分。当对转基因有机体进行基因型分型时,通常只需检测一段基因组区间即可。一个聚合酶链式反应常常足以完成转基因小鼠的分型,这对当今哺乳动物的医学实验极其重要。常用的基因型分型算法和工具包括:GATK , Mach 等,其中适用于家族研究的工具包括FamLDCaller, LDIV 等。'Genotyping Services' from Source Bioscience
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