摩德纳、雷焦和瓜斯塔拉公爵法兰西斯科五世，奥地利-埃斯特大公、匈牙利和波希米亚王室亲王、摩德纳、雷焦和米兰多拉公爵、瓜斯塔拉公爵、马萨公爵、卡拉拉亲王，法兰西斯科·费迪南多·杰米尼亚诺·冯·哈布斯堡-洛林（1819年6月1日－1875年11月20日），是一位执政亲王。自1847年起是摩德纳、雷焦和米兰多拉公爵、瓜斯塔拉公爵，1846年至1859年间是马萨公爵和卡拉拉亲王。他的父母是摩德纳公爵法兰西斯科四世和萨伏依的玛丽亚·贝亚特丽切。他是摩德纳公国被并入意大利王国前的最后一任公爵。
法兰西斯科出生后5天即在本城主教座堂由总主教施洗，前神圣罗马帝国皇帝、奥地利皇帝弗朗茨一世是他的教父，但由法兰西斯科的叔父斐迪南代理。
1824年1月10日，法兰西斯科的外祖父撒丁尼亚前国王维托里奥·埃马努埃莱一世去世，玛丽亚·碧翠丝继承了他对不列颠的权利，被詹姆斯党人奉为王，法兰西斯科也因而被他们称为“英格兰、苏格兰、法兰西和爱尔兰的弗朗西斯王子，康沃尔和罗撒西公爵，卡里克伯爵，伦弗鲁男爵，列岛领主，苏格兰亲王和上议院特别刑事审判长”。
1826年，法兰西斯科四世任克莱门特·科罗尼尼伯爵为儿子的教师，由后来成为卡皮和雷焦艾米利亚主教的唐·皮耶特罗·拉菲利辅助。1829年，厄内斯特·格兰男爵成为小法兰西斯科的新教师。
1836年9月15日，法兰西斯科成为奥地利金羊毛骑士团的一员，1839年获得尼德兰之狮勋位的大绶勋章。
1840年法兰西斯科的母亲去世后，法兰西斯科被詹姆斯党认为是英格兰、苏格兰和爱尔兰的王位继承人“弗朗西斯一世”。他死后，弟弟的女儿奥地利-埃斯特的玛丽亚·特雷西亚成为了詹姆斯党继承人。
1841年，法兰西斯科又获得萨伏伊至圣报喜勋位大链章。
1842年3月30日，法兰西斯科在慕尼黑王宫娶巴伐利亚国王路德维希一世和萨克森-希尔德堡豪森的特丽莎公主夫妇的第三女阿德尔冈德为妻。慕尼黑-弗莱兴总主教主持了他们的婚配圣事。他们只有一个孩子安妮·碧翠丝公主（1848年10月19日生于博尔察诺的格里斯 - 1849年7月8日卒于摩德纳）。
1846年1月21日，法兰西斯科四世去世，法兰西斯科继承了他，成为摩德纳公爵。作为哈布斯堡-洛林王朝的幼支后裔，他从出生起就拥有奥地利大公、匈牙利和波希米亚王室亲王的头衔，还从父亲处继承了雷焦艾米利亚公爵、米兰多拉公爵、马萨公爵、卡拉拉和卢尼吉亚纳亲王的头衔。
1847年12月18日，和法兰西斯科同一个曾祖父的法国皇后玛丽·路易莎去世，法兰西斯科又继承了她成为瓜斯塔拉公爵。
在1848年的革命浪潮中，法兰西斯科虽然召来奥地利军队保护自己，但仍然为起事者所迫逃离摩德纳，次年被奥地利军队复立。他起初表现得宽容，但当有人刺杀他后，他又恢复了暴政。
1855年，法兰西斯科创立了埃斯特之鹰勋章，自封为首领。
1859年，法军和皮德蒙特军队入侵摩德纳公国。在马真塔战役中，奥地利战败，被奥地利保护的法兰西斯科也于6月14日撤离摩德纳。1860年3月18日，在撒丁尼亚国王维托里奥·埃马努埃莱二世敕令下，摩德纳并入新成立的意大利王国。3月22日，法兰西斯科对此表示抗议。
1860年后，法兰西斯科在维也纳退隐，住在摩德纳宫。他在巴伐利亚的威尔登瓦尔特城堡也保有一处夏季定居点。他大部分时间在奥地利度过，偶尔旅行，1864年到过中东地区。
1861年3月7日，英国事实上的财政大臣威廉·格莱斯顿在下院言语攻击法兰西斯科，主要指控法兰西斯科实施过度惩罚，违反了刑事诉讼程序。同年晚些时候，诺曼比侯爵康斯坦丁·菲普斯出版了一本书，驳斥了格莱斯顿对法兰西斯科的所有指控。
1875年11月20日，法兰西斯科在维也纳去世，他的庞大产业大多留给了他的本家侄孙、后来的奥地利-埃斯特大公弗朗茨·斐迪南。他的遗体葬于维也纳嘉布遣会教堂。摩德纳公爵的头衔自此以后被两个家族持有，一是奥地利-埃斯特家族，二是法兰西斯科五世的侄女婿巴伐利亚国王路德维希三世及其后代。
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