1992年6月30日，日本表示愿意接受《保护世界文化和自然遗产公约》（Convention Concerning the Protection of the World Cultural and Natural Heritage），其历史遗迹获得了列入《世界遗产名录》、成为世界遗产的资格。直至2019年7月，日本共有23项世界遗产，包括19项文化遗产、4项自然遗产。另外，直至2018年，共有7个遗产和1个扩大登录遗产录入预备名单中。
预备名单包括以前曾经提名但尚未登录的遗产。
2012年1月，日本政府要求在2013年将镰仓的预备遗址登录为正式的世界遗产，并在柬埔寨金边举行的第三十七届世界遗产委员会会议审议了这项请求。国际文化纪念物与历史场所委员会(ICOMOS)建议不要将镰仓登录为正式的世界遗产，并表示该遗址的历史方面在很大程度上被现代化的城市所替代，因此该遗址缺乏必要的完整性。
在2016年日本文化事务署提名长崎的教堂和基督教遗址，但教科文组织咨询国际文化纪念物与历史场所委员会小组后决定撤回，指出日本未能解释总体价值，因而要求日本审查其提名。其后在2018年以长崎与天草地区的隐性基督徒关连遗产再次申请成功。
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