两部神道，又称两部习合神道，是指以佛教密宗的立场解释神道。
在密宗教义中，宇宙是大日如来的示现，分别演示出金刚界曼荼罗和胎藏界曼荼罗。在两部神道中，日本国神则是佛菩萨的本地垂迹。
两部神道中，伊势内宫的祭神天照大神是胎蔵界中的大日如来，伊势外宫的丰宇气毘卖神是金刚界的大日如来，伊势神宫的内宫和外宫分别象征金刚界和胎藏界。
另一方面，日本书纪的三神分别代表佛的三身：国常立尊是法身，国狭槌尊是报身、丰云野神是应身，三神合一就是大日如来。
另外，古事记中的神世七代等于佛教中的过去七佛。
两部神道的出现，是因佛教传入日本，神道受影向而萌芽。
进入奈良时代后，出现日本神和日本人一样愿听佛法受救度的想法，出现了神宫寺，和尚在神社读经的情况。
在8世纪真言宗和天台宗传入日本后，两部神道正式理论化。
两部神道对后世神道影向极大，修验道与后世很多习合神道教派也是它的支流。
相反，在14世纪出现了反本地垂迹的伊势神道，吉田神道也是与这一派有关。
明治元年发布神佛分离令后，两部神道遭到毁灭性打击，终结了神道中佛主神从的主流派地位，同时终结神道依附佛教发展的时代。
