自由巴布亚运动（印尼语：Organisasi Papua Merdeka，简作OPM），是南太平洋地区西巴布亚（现由印尼控制）的一个分离主义组织，目标是寻求西新几内亚脱离印尼统治而实现独立。自由巴布亚运动成立于1965年。该地区包含印尼治下的西巴布亚省与巴布亚省。
该组织的主要支持者为当地的原住民巴布亚人（美拉尼西亚人的一支）。他们自认为与印尼没有历史与文化上的联系。按照自由巴布亚运动的观点，印尼对西新几内亚的统治为军事占领。目前，自由巴布亚运动被印尼政府视为恐怖组织。
1949年，荷属东印度停止运作而成为独立的印度尼西亚，荷兰重新得到新几内亚西部的主权，并准备建立一个独立国家。
1961年4月5日巴布亚议会开始运作，预备于10年之内完成独立。
1961年12月1日，荷兰认同其议会所选择的国歌以及订定晨星为新的国旗。
1961年12月18日，印度尼西亚入侵西巴布亚。
1969年，西巴布亚并入印尼版图。自从印尼入侵西巴布亚之后，当地的抵抗运动便从未停止。
1971年1月，该组织试图再次宣布独立，并成立西巴布亚共和国，但不久便归于失败。
2000年5月29日至6月4日，2700名巴布亚人代表在查亚普拉召开了巴布亚全国代表大会，会议通过了一个决议草案，草案中宣称巴布亚将脱离印尼统治而独立，印尼总统瓦希德宣布此草案为非法。
2001年9月28日，自由巴布亚运动的武装组织袭击并一度占领了查亚普拉以南700公里的伊拉加。
2004年，由流亡英国的西巴布亚领导人本尼·温达设立自由西巴布亚运动，鼓励联合国在西巴布亚举行独立公民投票。 该运动获得愈来愈多国际支持和值得注意的人物支持，如诺贝尔和平奖得主大主教德斯蒙德·图图。截至2010年，有13,500名西巴布亚难民生活在邻国巴布亚新几内亚，偶尔有越界战斗，因此巴布亚新几内亚国防军在其西部边界设立巡逻队，防止自由巴布亚运动人士进入。此外，巴布亚新几内亚政府持续驱逐越界的西巴布亚居民，承诺没有诠行反印尼活动是西巴布亚移民留在巴布亚新几内亚的条件。2012年，印尼总统苏西洛·班邦·尤多约诺对运动发出了逮捕令。
2017年12月俄罗斯战略轰炸机首次获印尼许可降落在巴布亚省空军基地，外界解读为一次印尼对西方的警告：若再有西方力量意图在巴布亚省掀起事端，那印尼将倒向中俄势力，并借助俄罗斯的武力，发挥反向作用；同时俄罗斯也借此表态，认为苏联解体后居于守势地位，让欧美步步进逼的状况将终结，从此俄国也要进入传统欧美认为较能控制的战略地带经营势力，遍地开花地进行影响力争夺战略。
