斯特凡二世（德语：Stephan II.，1319年－1375年5月13日），巴伐利亚公爵，神圣罗马皇帝路易四世与第一任妻子西里西亚的碧翠丝（英语：Beatrice of Silesia）所生的次子。巴伐利亚公爵路易五世的同母弟。
在路易四世统治期间，斯特凡担任士瓦本和亚尔萨斯的信使。路易四世获得勃兰登堡侯国、蒂罗尔伯国、荷兰伯国和埃诺伯国（英语：County of Hainaut）为他的领地，但他还于1329年为维特尔斯巴赫家族的普法尔系放弃上普法兹。当他的父亲路易四世于1347年去世时，斯特凡二世与他的五位兄弟一起继承巴伐利亚公爵、荷兰伯爵、泽兰伯爵和埃诺伯爵（英语：County of Hainaut）等爵位。1349年9月12日，巴伐利亚在低地国家的维特尔斯巴赫家族财产被分割：路易五世和路易六世（罗马人）和奥托五世分得上巴伐利亚；斯特凡二世则与威廉一世和阿尔布雷希特一世分得下巴伐利亚及巴伐利亚-施特劳宾（荷兰伯国和埃诺伯国）。本来斯特凡二世从1349年到1353年与他的兄弟威廉一世和阿尔伯特一世一起统治荷兰和下巴伐利亚兰茨胡特等地，但自1353年以来他仅在下巴伐利亚兰茨胡特统治。
在维特尔斯巴赫家族最终与新任神圣罗马皇帝查理四世暂时和解及确认维特尔斯巴赫家族的领地拥有权后，斯特凡二世于1354年加入查理四世远征意大利大军中。但由于1356年金玺诏书中仅是维特尔斯巴赫家族的普法尔茨分支和他的弟弟勃兰登堡藩侯路易二世被赋予选侯的身份，因此不久又引起新的冲突。1362年，斯特凡二世是皇帝路易四世的最后一个儿子被取消绝罚。
当他兄长勃兰登堡人路易五世的儿子迈因哈德于1363年去世时，斯特凡二世在立即继承上巴伐利亚并入侵蒂罗尔伯国。斯特凡二世为了加强自己实力与奥地利公爵鲁道夫四世，他与贝尔纳波·维斯孔蒂（英语：Bernabò Visconti）结成同盟。最终于1369年当玛格丽特·莫加许（英语：Margaret, Countess of Tyrol）逝世后，斯特凡二世与哈布斯堡王朝签订谢尔丁和约放弃蒂罗尔伯国以换取巨额经济赔偿。
斯特凡二世与弟弟路易六世在迈因哈德的巴伐利亚遗产继承权上冲突，最终也导致维特尔斯巴赫王朝失去了勃兰登堡侯国，因为路易六世随后将皇帝查理四世任命为他的继承人。但是，斯特凡二世在1373年回到巴伐利亚后，接受最后一位维特尔斯巴赫家族勃兰登堡藩侯幼弟奥托作为名义上的摄政。由于勃兰登堡侯国的损失，巴伐利亚公爵又一次获得经济补偿。斯特凡二世的领地由他的三名儿子继承。
斯特凡二世被安葬在慕尼黑圣母主教座堂。
1328年，斯特凡与西西里国王费德里科二世的女儿伊莎贝拉（英语：Elisabeth of Sicily, Duchess of Bavaria）结婚，两人共有三个儿子：
