16S 核糖体RNA

✍ dations ◷ 2025-04-25 11:59:36 #16S 核糖体RNA
16S核糖体RNA(16S ribosomal RNA),简称16S rRNA,是原核生物的核糖体中30S亚基的组成部分。16S rRNA的长度约为1,542 nt。卡尔·乌斯和乔治·福克斯是率先在系统发育中使用的16S rRNA基因的两个先驱者。一个细菌的细胞中可包含多个具有不同序列的16S rRNA。已知16S rRNA具有如下几项功能:由于不同种的真细菌与古细菌间的16S rRNA基因(16S rDNA)是高度保守的,16S rDNA常被用于对各种生物进行的系统发生学方面的研究这种运用16S rRNA对生物进行系统发生学研究的方法由卡尔·沃斯(Carl Woese)开创。另外,线粒体和叶绿体中的rRNA也都被扩增了。在获得能提供系统发育学信息的16S rRNA分子时需要利用通用PCR引物对16S rRNA分子进行扩增。16S rRNA序列的对比分析需要在这类“通用引物”的脱氧核糖核酸分子的辅助下完成,这类分子具有如下序列:这类引物因并未在近期发现的几种属于纳古菌门(Nanoarchaeota)的热液古菌中分离识别出来,也被称为准通用引物。除了高度保守的引物结合位点之外,16S核糖体RNA基因序列包含高变区,可以提供具体物种的签名序列用于鉴定细菌的有用的。其结果是,16S核糖体RNA基因测序已经成为医学微生物学普遍的作为一种快速和廉价的鉴定细菌表型方法的替代方法。尽管它最初用于鉴定细菌,随后16S测序被发现能够重新分类细菌进入完全新的物种,或者甚至是属。它还已经被用于描述具有从未被成功培养的新物种。因为它存在于大多数微生物并显示适当的变化,16S rRNA基因被用作分类鉴定微生物的标准。大多数细菌和古细菌的16S rRNA基因序列型菌株可在公共数据库得到,例如NCBI数据库。然而,在这些数据库中发现的序列的质量往往没有验证。因此,只收集16S rRNA序列辅助数据库被广泛使用。最经常使用的数据库如下:1) EzTaxon(英语:EzTaxon Database)-e. https://web.archive.org/web/20130928154318/http://eztaxon-e.ezbiocloud.net/2)核糖体数据库项目。http://rdp.cme.msu.edu/ 核糖体数据库项目(RDP)。3) SILVA.4) Greengenes. Greengenes是基于新生系统发生,提供了标准的操作分类单元集的质量控制,全面的16S参考数据库和分类。该网站的官方主页是http://greengenes.secondgenome.com,并在Creative Commons许可BY-SA3.0许可。

相关

  • 交沙霉素交沙霉素又称为“角沙霉素”,是一种大环内酯类抗生素(分子中包含一个14元环)。交沙霉素为白色或微黄白色结晶性粉末,无臭,味苦,极易溶于乙醇、乙醚或氯仿,极微溶于水。该抗生素由那
  • 精囊精囊(英语:Seminal vesicle,亦称为储精囊),功用为提供和储存精液的分泌物,内含有黏液、果糖(精子能量)、凝集酵素、抗坏血酸、前列腺素,但并不储存精子。精液有60%左右的成分来自于此
  • 矿物矿物是指在地质作用下天然形成的结晶状纯净物(单质或化合物)。绝对的纯净物是不存在的,所以这里的纯净物是指物质化学成分相对单一的物质。矿物是组成岩石的基础(像石英、长石、
  • LycosLycos是一家互联网搜索引擎公司和门户网站。最早诞生于1994年麦克·马丁博士(Dr.Michael Mauldin)在Carnegie Mellon大学的一个搜索项目,当时的Lycos搜索引擎被用于该校的数字
  • 相干逻辑相干逻辑,也叫做相关逻辑,是一类非经典亚结构逻辑,它在蕴涵上施加了特定限制。(一般但不完全的,澳大利亚逻辑学家称之为relevant logic,其他说英语的逻辑学家称之为relevance logi
  • 脊神经脊神经(spinal nerve)在脊髓和身体之间传递信号。信号混合有运动神经,感觉神经和自主神经的信号。在人体中有31对脊神经(spinal nerves),每一对脊神经在脊柱的双侧。分在脊柱的
  • 生物无机化学生物无机化学是研究金属在生物体内角色的学科,生物无机化学研究像金属蛋白及金属酶等天然的生物分子,金属与生物分子的相互作用,如金属离子通道,也研究在医药(金属药物)及毒物学中
  • 执照执照旧时指官府所发的文字凭证,今指由行政主管机关应公民、法人或其它组织的申请,对符合法定条件的申请人依法发给的准许从事某种行业、工作或特殊活动的正式凭证,是许可证的一
  • 达·芬奇列奥纳多·达·芬奇(意大利语:Leonardo da Vinci;儒略历1452年4月15日-1519年5月2日),又译达文西,全名列奥纳多·迪·瑟皮耶罗·达·芬奇(Leonardo di ser Piero da Vinci,意为“芬奇
  • 霜冻酸奶冻酸奶是用酸奶,有时候用其他乳制品制成的冷冻甜点。它通常比冰淇淋酸,脂肪也比较少 (因为使用的是牛奶而不是奶油)。它跟牛奶冻 (近几年被称之为低脂肪或轻冰淇淋)和常见的霜淇淋