卡那卡那富语音系（Kanakanavu phonology）为卡那卡那富语之音系。而其音系之音位大都使用适当的Unicode符号来标示。在台湾南岛语的书写系统的订定上，元辅音之音系表原则上都是先“发音部位”（横列）、后“发音方法”（纵列）、再考量“清浊音”，来订定其音系之音位架构。
卡那卡那富语正式使用的拉丁字母有17个、及1个二合字母（ng），其余拉丁字母（用括号；b,d,f,g,h,j,q,v,w,x）用在外来语上。 而零声母（喉音塞音（清音））以一撇（'）符号表示或省略。台湾南岛语的书写系统的订定，原则上都是先“发音部位”、后“发音方法”、再考量“清浊音”，来订定其书写字母。
字母表内“舌尖闪音l”及“舌尖颤音r”，早期卡那卡那富族长辈可清楚的发出两种不同的的声音，惟演变至今，族人已无法分辨，目前两种声音已合而为一，保留“r”的音。
下列子母音表中的音素大都使用适当的Unicode符号来标示。从下表可看出，卡那卡那富语在喉音、舌根音、舌面音方面小量的退化，而舌尖音、与唇音方面却较广泛的使用。
在邹语群的音素上，比如：字母/l/分别代表邹语的浊卷舌塞音/ɗ/与南邹舌尖闪音/ɽ/。邹语中代表舌尖卷舌音/ɽ/的字母/l/，仅出现在久美方言里：达邦和特富野方言并无此音。卡那卡那富语和沙阿鲁阿语也没有舌尖卷舌音/ɽ/，但有舌尖颤音/r/，故其书写系统亦以/r/字母代表之。沙阿鲁阿语中表清齿龈边擦音/ɬ/的字母，仍以/hl/书写。邹语的半闭前不圆唇元音/e/，卡那卡那富语和沙阿鲁阿语的中央元音/ǝ/，均以字母/e/表之。邹语的元音长短有辨义的作用，长音的书写方式是将长元音写二次。如：puutu（汉人）/putu（锤子）。
