抗菌肽

2FBS, 2FBU, 2FCG, 2K6O, 2LMF, 4EYC· cell wall · cytosol· antibacterial humoral response · defense response to bacterium · negative regulation of growth of symbiont on or near host surface · defense response to Gram-positive bacterium · interaction with host · killing by host of symbiont cells抗菌肽（Cathelicidin），系一系列可在巨噬细胞和中性粒细胞的溶酶体中找到的具有抗菌作用的多肽。这种多肽在哺乳动物对侵袭性细菌感染的先天免疫中扮演着重要的角色。抗菌肽家族被归为抗微生物肽（antimicrobial peptides ，缩写为AMPs）的一种。防御素则是抗微生物肽家族的另一成员。尽管抗菌肽家族与防御素具有相同的结构特征，但它们却具有高度异质性。抗菌肽家族的成员可通过一个高度稳定的区域（即凯萨林域（cathelin domain））和另一个高度可变的域来表征。哺乳动物的各个种的抗菌肽之间是互相孤立的。最初，科学家在中性粒细胞中发现了抗菌肽，不过，随后，科学家发现，在经过细菌或病毒或骨化三醇（维生素D的活性形式）的刺激后，上皮细胞和巨噬细胞中亦会产生抗菌肽。结构 / ECOD抗菌肽的长度范围很大，其长度可从12个氨基酸残基到80个氨基酸残基。它们的结构也千变万化。大部分的抗菌肽均为折叠成两亲性的α螺旋的长为23-37个氨基酸的线状肽。不过也有小部分的抗菌肽长度在12-18个氨基酸之间。这类肽有一到两个起稳定结构作用的二硫键，且拥有β发夹（英语：beta hairpin）结构。科学家也有发现长度较长的抗菌肽（长度在39-80个氨基酸残基之间）。这些长度较长的抗菌肽呈现出重复的脯氨酸基序，形成了延长的聚脯氨酸型结构。抗菌肽与半胱氨酸蛋白酶抑制剂（英语：Cystatin）家族有着一级同源性，尽管那些被认为很重要的氨基酸残基在这一蛋白酶抑制家族中往往难以找到。抗菌肽家族的成员在人类、猴子、小鼠、大鼠、豚鼠、熊猫、猪、牛、青蛙、绵羊、山羊、鸡，还有马体内都有分布。如今已被确认的抗菌肽有：患酒渣鼻的患者体内的抗菌肽水平和角质层胰蛋白酶酵素（SCTEs）水平会升高。在激肽释放酶7（英语：KLK7）（KLK7）和激肽释放酶5（英语：KLK5）（KLK5）的共同作用下，抗菌肽能被切割成抗微生物肽LL-37。LL-37过量被认为是引发酒渣鼻（无论是其哪一亚种）的罪魁祸首之一。抗生素已被用于酒渣鼻的治疗，然而，抗生素之所以起作用，或许仅仅是因为它部分抑制了角质层胰蛋白酶酵素。维生素D能提高的人体内抗菌肽hCAP18的水平，而hCAP18据信能有效降低接受透析的患者因感染而造成的死亡风险。拥有高水平hCAP18蛋白的患者经过一年透析之后能存活并免受致命感染的概率是一般患者的3.7倍。。维生素D能够增强抗菌肽相关基因的表达，而抗菌肽又对细菌，真菌和病毒具有广谱抗微生物活性。抗菌肽能在巨噬细胞内的吞噬体与溶酶体融合后快速摧毁原来吞噬体里的微生物的脂蛋白膜。针对抗菌胜肽，提供相关资讯的研究型数据库，如:dbAMP 。 dbAMP 为一个综合型抗菌胜肽数据库，其中所包含的资讯有抗菌胜肽蛋白质序列、名称、物种来源、抗菌物种分类、抗菌胜肽的物理性质、是否经实验研究证明以及蛋白质结构分析与图形化等资讯，此些数据库同时也提供抗菌胜肽等预测工具，供使用者浏览、分析及研究应用。