朱万年(?-1632年),字鹤南,明朝贵州黎平人。
万历三十七年(1609年)举人,历任山东定陶县知县、北京中城兵马司指挥、户部河南清吏司主事、员外、郎中,莱州府知府。
崇祯四年(1631年)闰十一月,孔有德在吴桥发动兵变,第二年正月,攻克登州府。朱万年拒绝孔有德的招降,率兵坚守莱州。崇祯帝派山东巡抚徐从治、登莱巡抚谢琏率军到莱州援助朱万年。四月,徐从治被孔有德的红衣大炮击伤而死。七月,孔有德假意请求招安,崇祯帝命谢琏、朱万年到孔有德营中宣旨,被孔有德所俘虏。孔有德命朱万年劝降城中,朱万年不屈而死。崇祯六年四月,明军平叛,孔有德渡海投降后金。