藤堂高次（日语：藤堂 高次／とうどう たかつぐ ，1602年1月4日—1676年12月20日）是伊势津藩第2代藩主。藤堂家宗家第2代。父亲是津藩初代藩主藤堂高虎。
在庆长6年（1602年）出生，家中嫡男。高虎在此前一直没有儿子，于是迎丹羽长秀的儿子高吉为养嗣子。在高虎46岁时，终于等到儿子高次出生。宽永7年（1630年），因为高虎病死而继承家督。高吉在宽永9年（1632年）从伊予今治转封至伊势，不过在宽永13年（1636年），因为高次命令而转封至伊贺名张，成为名张藤堂家。
宽永9年（1632年），修复江户城二之丸。宽永14年（1637年）7月开始，卷入生驹骚动。宽永16年（1639年），修复江户城本丸。庆安5年（1652年），在日光的大猷院灵庙（德川家光的灵庙）等地进行石垣普请，这些石垣普请令津藩的财政极度恶化，于是为了增收年贡以改善财政，积极奖励开发新田等，进行改革。不过因为积极负担江户幕府的普请费用，令财政更加恶化。
在宽文9年（1669年）隐居，把家督让予长男高久。在延宝4年11月16日（1676年12月20日）死去。享年74岁。
