冠状病毒亚科

正冠状病毒亚科（学名：Orthocoronavirinae）通称冠状病毒（英语：Coronavirus），是一类在动物与人类之间传播的人畜共患的RNA病毒。冠状病毒可感染哺乳动物、鸟类，引起牛和猪的消化道疾病或鸡的上呼吸道疾病。自然界常见，已知可感染人类的冠状病毒共有七种，会引起人类的呼吸道感染，可引发普通感冒，乃至中东呼吸综合征（MERS）和严重急性呼吸综合征（SARS）、2019年冠状病毒疾病（COVID-19）等较严重疾病。冠状病毒亚科属于网巢病毒目冠状病毒亚目（Cornidovirineae）冠状病毒科，又分为α、β、γ、δ等四个属。冠状病毒的基因组大小在26,000至32,000个碱基对之间，是基因组规模最大的一类RNA病毒。冠状病毒在电子显微镜下呈球状或椭圆形，上有规则排列的囊状胶原纤维突，形似皇冠状，因此得名。该病毒囊膜由双层脂质组成，穿插膜蛋白和纤突蛋白，某些还会有血凝素。病毒内部为RNA和衣壳蛋白组成的核蛋白核心，呈螺旋式结构。冠状病毒最早发现于1960年。最早为在禽类中发现的禽类传染性支气管炎病毒（IBV），后在患普通感冒的人类鼻腔中检测出两例，分别命名为人类冠状病毒229E与人类冠状病毒OC43。冠状病毒的成员还包括2003年的严重急性呼吸系统综合症 ，又称非典型肺炎或SARS。 2004年的人类冠状病毒NL63。2005年的人类冠状病毒HKU1。 2012年发现的中东呼吸综合征冠状病毒。2019年发现的2019新冠病毒。上述病毒大多会引起严重的呼吸道感染。病毒进入人体细胞后，病毒会脱掉外壳将核糖核酸（RNA）基因组释放到细胞质中。冠状病毒的RNA基因组有5'甲基化的端帽和3'多聚腺苷酸化的尾。 这使它可以附着在人类的核糖体上进行转译。目前已有七个已知的人类冠状病毒种类。其中，严重急性呼吸系统综合症冠状病毒(SARS-CoV)(广东肺炎)、中东呼吸综合症冠状病毒(MERS-CoV)(中东肺炎)及严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2型（SARS-CoV-2）(新冠肺炎)三种可引起致命的呼吸系统疾病。其余四种冠状病毒是人类感冒的常见病原体，通常不会造成严重疾病，只限于可能会在少数免疫力差的患者身上出现肺炎等并发症。1970年代初期，确认冠状病毒可以在动物间传播。症状主要为禽类的传染性支气管炎，还有肠胃疾病相关症状。冠状病毒主要传染哺乳动物和鸟类的上呼吸道和 肠道。 目前有七个已知的冠状病毒可以传染给人类。人类中大部分的感冒是由冠状病毒引起。冠状病毒引起感冒主要症状包括发烧，喉咙肿胀，多发于冬季和春季。冠状病毒可能导致肺炎，包括病毒性肺炎或细菌性肺炎和支气管炎。广受大众关注的SARS具有独特的发病机理，因为它会同时导致上层和下呼吸道感染。冠状病毒的重要性和对经济的影响是难以评估的，且与人类鼻病毒(另一个种导致普通感冒的病毒)不同，感染人类的冠状病毒通常很难在实验室环境里培养。冠状病毒也会在家畜和宠物中传播，有时会对农畜业造成重大的打击。禽类传染性支气管炎病毒（IBV），不仅会攻击禽类的呼吸系统，还会引起泌尿生殖系统疾病，病毒会在禽类体内不同的器官间传播。猪传染性胃肠炎病毒（TGE）、猪流行性腹泻病毒（PEDV）等多种冠状病毒均可导致幼年猪类腹泻与死亡。冠状病毒也可引发猫类动物、貂类动物、犬类动物以及鼠类动物相关疾病。一种与菊头蝠冠状病毒HKU2（Bat-CoV HKU2）有关、源自于蝙蝠的猪急性腹泻综合征冠状病毒（SADS-CoV；SADS冠状病毒）可导致猪类腹泻疫情。冠状病毒的源头最晚可追溯到公元前8000年。 也有可能是公元前8100年。非冷血飞行动物，蝙蝠和鸟类似乎是冠状病毒最佳的宿主（蝙蝠携带甲型冠状病毒属，乙型冠状病毒属；鸟类则携带丙型冠状病毒属和丁型冠状病毒属）。家畜冠状病毒和狗呼吸系统冠状病毒来自于1951年的一个共同祖先。 家畜冠状病毒和人类冠状病毒OC43于1899年开始分别独立演化。18世纪家畜冠状病毒由马冠状病毒中分离出来。人类冠状病毒OC43也有可能是于1890年从家畜冠状病毒中分离出来的产物。人类冠状病毒OC43的最近共同祖先已经追溯到1950年代。寄存于蝙蝠的冠状病毒和导致严重急性呼吸道综合症的SARS病毒于1986开始出现分歧。SARS病毒被指出与蝙蝠有密切联系。研究人员表明，冠状病毒与蝙蝠进行了长期的共同演化，SARS病毒最早由旧世界叶形鼻蝙蝠(leaf-nosed bat)携带，随后传染给菊头蝠科蝙蝠，之后传染给果子狸，最后传染给人类。