科佩尔（斯洛文尼亚语：Koper；意大利语：Capodistria），位于斯洛文尼亚西南部与意大利的边境地区，亚得里亚海北端，是斯洛文尼亚全国唯一的商业港口。该市全境约311平方公里，人口47539人，斯洛文尼亚语和意大利语同为该市官方语言。
科佩尔早在希腊化时代便已建城，希腊语称之为Aegida，其拉丁语名称Capris更为流行，今日Koper一词便是Capris的变音。568年，附近罗马帝国城市的里雅斯特的大量市民为躲避伦巴德人入侵而逃来该市，使得该市开始繁荣。当时，该市处于东罗马帝国治下，其名字也为纪念查士丁尼二世而改为“查士丁诺波尔”。不久以后，该地被并入伦巴底王国，后又随着伦巴底被兼并入法兰克王国。
932年，科佩尔开始与威尼斯建立起稳定的贸易关系。虽然如此，当威尼斯和神圣罗马帝国发生冲突时，科佩尔却站在帝国一边。因此，康拉德二世于1035年授予科佩尔自治市镇的地位。但是，1232年，科佩尔被划入了阿奎莱拉大主教区，1278年随之并入威尼斯共和国，被更名为“Caput Histriae”，意为“伊斯特利亚之都”，今日Capodistria一词便来自于此。
哈布斯堡家族夺得神圣罗马帝国皇位后，科佩尔作为的里雅斯特的一部分，被划成奥地利的领地。一战之后，被奥地利割让给意大利。二战之后，科佩尔作为第里雅斯特自由区的B区一部分，1954年被正式划入南斯拉夫，其意大利裔居民多半迁走。
1991年，随着斯洛文尼亚的独立，科佩尔成为其唯一的商业港口。
