林恭章（1562年－1631年），字尔肃，福建兴化府莆田县人。明朝政治人物。
嘉靖四十一年倭寇破莆田，恭章母亲躲在棺材下面生下他，成长后，常常发誓以清修报答母恩。万历二十六年（1598年）戊戌科进士，初知海宁县，调阳江县，天性廉介，以教化为先。邑多猾吏，章刻意惩创，吏皆敛手。然至折狱，往往多哀矜流涕。盛暑必躬阅狱囚，日夕存恤。有村媪与子讼，意状甚逆，章愀然动色，携入衙署，跪白其母，母命设饮食，章盛衣冠侍母侧，观其母子同饭，顷之，媪与子泣且悟，叩头谢罪，乃喻遣之。居无何，丁母忧去，去之日，民遮道留衣履祀之。补新淦令，有能声。额赋听民自纳，不取羡余。贫民有鬻妻者赈之，使完聚。邑火，捐粟恤被灾者。在淦数月，召为都察院经历，转工部营膳司员外郎，管街道厅。天启元年（1621年），由吉安府知府升江西湖东道副使，历云南右参政、广西按察使，天启六年（1626年）七月升湖广右布政使，不久致仕归乡。家居三年，崇祯四年辛未卒。
