基质金属蛋白酶（英语：Matrix metalloproteinase）是钙依赖性的含锌内肽酶（英语：endopeptidase），属于金属蛋白酶。其他类似的内肽酶有adamalysin（英语：adamalysin）、serralysin（英语：serralysin）及astacin（英语：astacin）。基质金属蛋白酶属于蛋白酶中一个较大的家族，称为metzincin超家族（英语：metzincin superfamily）。
这些酶类可以分解各种细胞外基质的蛋白质，不过也可以处理一些生物活性（英语：Biological activity）分子。目前已知这些酶类参与细胞表面一些受体的分解、释放细胞凋亡配体（例如FAS配体（英语：FAS ligand））以及趋化因子/细胞因子的去活化。一般认为基质金属蛋白酶在许多细胞行为中扮演重要的角色，例如细胞增殖（英语：cell proliferation）、细胞迁移、（细胞粘附（英语：cell adhesion）/分散）、细胞分化、血管新生、细胞凋亡及免疫系统。
基质金属蛋白酶最早是在脊椎动物身上发现（1962），其中人类身上也有，不过在无脊椎动物及植物身上也曾发现有此酶类。它们和其他 内肽酶的差异是它们依赖金属离子为辅因子、可以分解细胞外基质的能力。以及它们特定的进化DNA序列。
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