马耳他女王（马耳他语：Reġina ta' Malta），是马耳他在1964年9月21日到1974年12月13日的国家元首头衔。
马耳他女王职衔现已废除，国家元首一职改由马耳他总统行使。
1964年马耳他从英国独立后，奉英国女王伊丽莎白二世为马耳他君主。因君主常驻英国，故而委任马耳他总督作为君主代表，在该国执行君主的权力。
1974年12月13日，《马耳他宪法》修改成国体为共和国并废除马耳他君主及马耳他总督，以马耳他总统作为该国的国家元首。
1992年5月28日至30日、2005年11月23日至26日和2007年11月20日，伊丽莎白二世访问了马耳他。她于2015年11月26日至28日以英联邦元首身份在马耳他出席了2015年英联邦会议。
马耳他自1964年从英国独立后到1974年变更国体为共和国之间只有经历一任君主：
伊丽莎白二世在马耳他的头衔分成两段时期：
Għall-Grazzja t'Alla tar-Renju Unit tal-Britannja l-Kbira u ta'l-Irlanda ta'Fuk u tar-Renji u t-Territorji l-OħraTagħha，Reġina， Kap tal-CommonwealthuDifenditriċilal-Fidi（蒙上帝的恩典，大不列颠与北爱尔兰联合王国和她其他王国及领地女王，英联邦元首，信仰的守卫者）
Għall-Grazzja t'Alla，Reġinaa'Maltau ra-Renji u t-Territorji l-OħraTagħha，Kap tal-Commonwealth（蒙上帝的恩典，马耳他和她其他王国及领地女王，英联邦元首）
