集装箱船是专门运输集装箱的船舶。由于集装箱又名“货柜”，因此集装箱船也可称为货柜船。1960年代航运业开始采用集装箱运输（英语：Intermodal freight transport），在此之前运输同类货物只能使用散货船，货物装卸十分费时，因此集装箱运输船舶的出现开始了水路运输的一个新时代：集装箱运输使得物流速度更快，安全性更高。配合集装箱运输的需求，各国的港口也开始设置起重机、集装箱卡车站等等支援设施。
第一代超巴拿马型集装箱船是美国总统轮船旗下五艘C-10级集装箱船。它们分别由不来梅伏尔铿（英语：Bremer Vulkan）造船厂和霍瓦兹船厂（德语：Howaldtswerke-Deutsche Werft）于1988年建造。全长275米，宽38.5米。总吨位61,296吨，载重吨位53,613吨，最大载柜量为4340TEU。
1991年，韩国的三星重工为法国公司CGM（今为CMA CGM）建造的投入服务。容量为4743TEU，是欧洲-远东航线中第一艘超巴拿马型船舶。
1994至1995年，由三菱重工业为航运公司铁行渣华的超巴拿马型集装箱船和分别交付并投入服务。1994年12月，日本石川岛播磨重工业（现改名为IHI公司）为日本邮船建造的三艘日邮Altair级船舶开始投入营运，该船长度由原本的275米，加长至299米，令其载柜量增至4943TEU。
1995年，海运公司商船三井的五艘型号相同的船舶开始交付。8月29日，东方海外旗下5344TEU船只投入营运。9月，霍瓦兹船厂（德语：Howaldtswerke-Deutsche Werft）和大宇造船（英语：DSME）又为美国总统轮船建造了6艘超巴拿马型船。当时（直到1999年初），该公司拥有最大的超巴拿马型船队，共有11艘此类型的船。
1996年1月，马士基旗下船只投入服务，该船成为有史以来第一艘超大型集装箱船(VLCS)，也是第一艘长度突破300米的集装箱船。凭着7403TEU的最大载柜量成为全球最大的集装箱船。
2005年7月11日，地中海航运公司旗下集装箱船投入服务，成为第一艘全宽达到45米的集装箱船。
2008年10月17日，法国达飞海运集团旗下集装箱船投入服务，该船能容纳11262TEU，成为第一艘最大载柜量突破10000TEU的超巴拿马型集装箱船。。
由丹麦欧登塞钢船厂（丹麦语：Odense Staalskibsværft）建造的艾玛·马士基号2006年9月投入服务，最大载柜量达到15500TEU。动力引擎为瓦锡兰（Wärtsilä）14RTFLEX96-C。马士基E级的8艘船的名称皆是以“E”字头的人名命名。全长397米，宽56.4米，最大吃水深度16米。并配备1000个冷藏柜插座用于装载冷藏柜。
此系列船只于2016开始进行升级，改装工程由青岛北海船舶重工公司负责，主要将驾驶台的高度加高以便将集装箱堆叠到甲板上更高的位置，令最大载柜量由原先的15500TEU，提高至17816TEU。
2008年，地中海航运公司旗下双岛式（Twin Island）集装箱船投入服务。全长366米，宽51.2米，专为巴拿马运河新闸道以设计，最大载柜量为13798TEU，其余7艘姊妹船也于随后一两年陆续投入服务。
2012年11月15日，第一艘可装载16000TEU的双岛式集装箱船交付，全396米，宽54米，最大载柜量为16022TEU。
2015年3月31日，第一艘可装载17722TEU的新巴拿马型集装箱船交付，全398米，宽54米，最大载柜量为16022TEU。
2011年2月，马士基宣布一份关于全新3E系列货轮的订单。该订单要求3E系列能容纳18000TEU。，并且也十分关注船舶的低耗油量。在初始合同中，这一系列将由韩国大宇造船海洋株式会社建造10艘，合同价值19亿美金（约合2万亿韩元），并且马士基有继续购买20艘该系列的选择权。在2011年6月，马士基宣布再订购10艘（价值19亿美金）
2013年，马士基向韩国大宇造船（英语：DSME）订造的3E级船舶开始陆续按期限交付使用，这批船全长399米，宽58米，能容纳18270TEU，成为当时世界上载运量最大的集装箱船。
2015年2月下旬，日本海运公司商船三井（现为海洋网联船务）向三星重工和今治造船订购6艘20000TEU，首艘于2017年3月27日投入营运，该船能容纳20170TEU，成为第一艘最大载柜量达到20000TEU的集装箱船。
2017年5月18日，东方海外旗下船只OOCL Hong Kong投入营运，该船最大载柜量达到21413TEU，成为第一艘最大载柜量达到21000TEU的集装箱船。
随着20000TEU的集装箱船出现，各船公司也纷纷开始订造载柜量达到23000TEU的集装箱船，设计上主要是把船桥的高度加高和推前以便将集装箱堆叠到更高的位置，并将全宽从原本的58米加长至61米，而且采用孤度较大的船艏外张，令其甲板上可装载24排集装箱。
2019年7月4日，地中海航运公司旗下第一艘极大巨无霸型集装箱船投入服务，该船的最大载柜量从原本极大型集装箱船（ULCS）的21000TEU，增加至23756TEU。
能建造7000TEU或以上大型集装箱船的造船厂，包括：
（日本邮船、商船三井、川崎汽船（英语：K Line））
2005年5月11日，马士基-海陆公司正式宣布以29.6亿美元（约23亿欧元）收购铁行渣华。5月10日，铁行渣华的股价为41美元，马士基-海陆公司在2005年8月5日结束的收购要向股东提供每股57美元的报价。收购于2005 年8月中旬完成。铁行渣华到2006年2月已不复存在。并完全拼入到马士基中。通过收购，马士基将其在全球集装箱运输中的市场占有率从12%增加到18%。
