芽室车站（日语：芽室駅／めむろえき */?）是位于北海道河西郡芽室町本通一丁目的北海道旅客铁道（JR北海道）根室本线的铁路车站。车站编号为k27。电报略号为メム。
根据北海道旅客铁道钏路分社，车站名称来自阿伊努语的“mem-oro-pet/メム・オロ・ペッ”→“メモロベッ”。
亦是“十胜”所有列车及“大空”部分列车的车站。
芽室车站属于2面3线，同时拥有岛式月台及侧式月台的地面车站。本线位于车站大楼旁的1号线，同时给上下行的特急及普通列车行驶。而2、3号线则作交换列车、避车处及带广方向的普通列车折返之用。
属于JR道东旅游服务的业务委托车站。设置绿窗口（营业时间6时40分～16时30分）及自动售票机。在营业时间以外，没有车站职员时，需要使用自动售票机购买车票。
1999年（平成11年）10月，在车站设置自动式时钟。在4月下旬至10月下旬期间，每天进行6次以人偶指挥的演奏。再加上另外每天4次的纯音乐演奏，每天合共进行10次演奏。
为芽室町的中心车站。
