温哥华参考文献格式（英语：Vancouver reference style），或称温哥华注释体系（英语：Vancouver system）、温哥华格式（英语：Vancouver style）等，是一种参考文献标注格式。该格式在正文中所引用的段落后标记数字序号，用来索引文后参考文献，故也时常被称为作者-序号体系（英语：author–number system）。温哥华格式在物理科学中比较流行，与哈佛参考文献格式（作者-时期体系）并列为医学领域最为常用的两种参考文献格式。医学界知名数据库MEDLINE（英语：MEDLINE）和PubMed采用的即为温哥华格式。
大量的科学期刊采用作者-序号体系，即遵循使用文内的编号数字指向文后的具体参考条目，但具体的操作则在标点、字母大小写、斜体等方面与狭义上的温哥华格式有着细微差别。作者-序号体系存在了超过一个世纪，而“温哥华格式”这一名称在1978年才开始出现。该格式的最新版本刊载在美国国家医学图书馆（NLM）的《引用医学（英语：Citing Medicine）》上，遵循ICMJE的推荐格式。
广义的温哥华格式就是指所有的作者-序号体系。较为狭义的理解有认为符合ICMJE推荐格式（英语：ICMJE Recommendations）皆为温哥华格式。而ICMJE推荐格式过去也被叫做原稿统一要求（英语：Uniform Requirements for Manuscripts，简称URM）。不过，像AMA格式（英语：AMA Manual of Style）虽然采用了温哥华格式的作者-序号体系，且符合URM，属于广义上的温哥华格式，但是AMA在斜体使用和引用序号是否使用方括号等方面与NLM/PubMed的格式有细微的差异，故而不被认为是更为狭义上的温哥华格式。
作者-序号体系出现于百余年前，与哈佛格式在长期以来一直都是科学期刊的主要参考文献格式之一。1978年，由各大医学期刊（英语：medical journal）的编辑组成的国际医学期刊编辑委员会（英语：the International Committee of Medical Journal Editors，简写作ICMJE）在加拿大温哥华举办会议，以制定统一的期刊文献要求。此次会议最终制定了《提交给生物医学期刊的原稿统一要求（英语：Uniform Requirements for Manuscripts Submitted to Biomedical Journals）》（英语：），简称《原稿统一要求》（英语：），缩写为URM。在《原稿统一要求》（URM）中，国际医学期刊编辑委员会（ICMJE）选定了作者-序号体系作为统一的参考文献格式要求。
《原稿统一要求》（URM）的诞生比互联网出现早15年。在互联网在科研圈中普及前，《原稿统一要求》（URM）的各类版本在国际医学期刊编辑委员会（ICMJE）的成员期刊中以文章或者补充资料的形式不断重刊再版，如1991年《英国医学期刊》（BMJ）再版、1995年《加拿大医学协会期刊（英语：CMAJ）》（CMAJ）再版、1997年《内科学年刊（英语：Annals of Internal Medicine）》再版等。1990年代晚期到2000年代早期，各期刊被要求在重刊《原稿统一要求》时以1997年《美国医学会杂志》版本为准。
2000年早期，随着互联网在学术领域的使用越发广泛，国际医学期刊编辑委员会（ICMJE）官方网站 （页面存档备份，存于互联网档案馆）上的格式要求逐渐变成公认的温哥华格式的最新版本要求，获取格式要求信息不再依赖参照出版在期刊上的最新版本《原稿统一要求》（URM）。例如，2004年起，意大利医学期刊《血液学（英语：Haematologica）》的编辑们便要求投稿文章作者直接访问国际医学期刊编辑委员会（ICMJE）官方网站以获取2003年修订版的《原稿统一要求》（URM）。
到了2000年代中期，负责维护医学文献作者信息检索网站MEDLINE（英语：MEDLINE）和PubMed的美国国家医学图书馆（NLM）开始主持修编ICMJE的“引用示例（英语：Sample References）” 页面。大约从2007年开始，美国国家医学图书馆（NLM）编写了《引用医学（英语：Citing Medicine）》这一文献引用格式指南，以详细阐述格式要求。如今的ICMJE推荐格式页面被重定向至《引用医学（英语：Citing Medicine）》，以更好地阐明温哥华格式的各项要求。
受到参考的文段用数字按照出现顺序在正文中依次编号：其形式为括号包裹的阿拉伯数字，如(1)、 、上标的1或者上标加方括号的。数字往往紧跟受到受参考文字后，或者正文中出现过的参考信息的一部分（如作者姓名、出版年份等）后：
" Hypovolemia is a massive decrease in blood volume, and death by excessive loss of blood is referred to as exsanguination. Typically, a healthy person can endure a loss of 10–15% of the total blood volume without serious medical difficulties."
在参考文献列表的第1项出可以找到所引用的文献相关资料。
有些地方要求温哥华格式使用时，数字序号应当放在文段标点之外，以免干扰语句阅读；而也有要求放在标点内的：总之不同的方法要求都存在。前者为一些大学或者机构所推荐，后者则是一些出版物的格式要求，如MLA格式、IEEE格式等，但在大段摘引末尾的要求又有所不同。但无论是ICMJE推荐格式（英语：ICMJE recommendations）还是URM这两项温哥华格式的基本文件都没有提到过对引用标记的陈列位置。
放在句号内：
" The detailed mechanism was still poorly understood."
放在句号外：
" The detailed mechanism was still poorly understood."
放在句中合适位置：
" A recent study shows that ......"
不同的引文类型（书籍、期刊文献等）有不同的格式要求。作者姓名都要求将姓氏前置后，只保留至多两个名字的首字母大写。名字的首字母大写是否合并书写（如“R. K.”简写为“RK“）实际并未被强制要求，但经常有合并书写、去除句点的情况出现。
如果一个期刊文献（Journal article）在一卷（Volume）中有连续页码，那么月份和发行期数（Issue）可以选择省略。如下例所示：
NLM中有所有文章以及其作者的信息，MEDLINE数据库中可以检索到这些讯息。但是，这些信息中一般只包含3-6名作者的讯息，其后的作者信息被省略，并以“et al.”标记，这一拉丁语标记在多数医学期刊中并不以斜体表示：
有时也会加上该文献的识别码（如DOI或者PubMed编号），下例即给出了PubMed编号，即PMID：
NLM会在页码书写方面可能有所省略，如将184-185简写为184-5。有的期刊会作如此的简记，但有的期刊则不允许这样的简记，也有简记与不简记混用的期刊。
实际上，多数的医学期刊都刊载在网上，甚至有不少只在网上刊载。对于出版时间的标记，NLM针对仅在网上刊载的文献要求在参考文献资料后补充写上“” ，对于电子出版早于纸质出版的要求写上“”并在日期一项上写电子出版的日期。但是，AMA格式（英语：AMA style）要求将”“放在引用文献标题后，如果没有印刷出版时间就不必在原先写日期的位置写上日期，只在方括号内写明即可。
期刊的名称往往被缩写，缩写名称中往往不包含表示缩写用的句号标记，在名称之后以句号结尾，以表示与下一项信息的分割。例如：“Environmental Science & Techonology”会缩写为“environ. sci. technol.”，在温哥华格式中会进一步缩写成“environ sci technol.”。名称缩写有一套规范，可以在网上的各类标准文件中查阅。但在以往，名称的缩写并不统一，有些缩写可能只在某些机构内部使用；如今，不同的标准文件（ at Appendix A: Abbreviations for Commonly Used English Words in Journal Titles、美国国家标准协会Z39.5标准、ISO 4、ISSN.org List of Title Word Abbreviations (LTWA) （页面存档备份，存于互联网档案馆）等）均已经统一了期刊名称缩写形式。
如下为法语的期刊文献条目写法：
原文语言全称写在编注文段的最后，即在页码或者出版地之后，以句号结尾，如上面的例子中在最后以“French.”注明了原文语言为法语。但是，NLM格式还要求以方括号形式在文章标题后添加标题的英文翻译。
作品为编者共同撰写，则不需要加注“editors”。
编者若仅负责选文组合，则需要加注“editors”。
文选或者其它类型书籍中有署名选段的引用，作者写选段署名，作品名称写选段名称，之后加上“In:”并在其后写上编者（加注“editors”）与书籍名称、版本、出版地、出版商与出版年份等信息。
电子资料是指从网站等处获得的资料，可能是政府或者机构的档案或者研究报告，也可能为单独的网页等。有时候会要求在在文献名称后、句点前标注“”。一般情形下都需要在最后加上“Available from:”并写上来源网址。在引用电子期刊时，也有时会按照“Available from:”并写上来源网址的形式书写。
不同医学机构有着独自的引文格式手册，如下是一些相关的信息：
