熊开元(1599年-1676年),字玄年,号鱼山,湖广嘉鱼县(今湖北)人,明朝政治人物,天启乙丑同进士出身。
天启五年(1625年)登乙丑科进士。崇祯元年(1628年)授直隶崇明县知县,改吴江县。崇祯四年(1631年)征授吏科给事中,请杀王化贞。后坐事贬官,为山西按察司照磨,迁光禄寺监事。崇祯十三年(1641年)迁行人司副。得罪周延儒,下狱。崇祯十七年(1644年)正月,遣戍杭州。
同年,李自成攻克京师,弘光帝召熊开元起吏科给事中。为母丁忧,不赴。隆武帝立,任命熊开元工科左给事中。连擢太常寺卿、左佥都御史,随征东阁大学士。后乞假归乡。隆武二年(1646年)八月,汀州被清军所破,熊开元弃家为僧,在苏州灵岩寺隐居而终。《明史》有传。
著有《诸方语录》、《蘖庵别录》、《渔山剩稿》等。