高能加速器研究机构（日语：高エネルギー加速器研究機構，简称KEK）原为隶属于日本文部省的国家实验室，于2004年改制为法人后，隶属于日本大学共同利用机关法人，为高能物理学与加速器科学的综合研究机构。KEK最早是在1997年4月1日，由原来的高能物理研究所、东京大学原子核研究所以及东京大学理学院所附属的介子科学研究中心改组而成的，成为一所综合研究所大学（综合研究大学院大学）。
简称为KEK，是沿用原来的高能物理研究所的略称。同时，原来的高能物理研究所，是日本最早提供万维网服务的公开机构。
身为原高能物理研究所教授、基本粒子原子核研究所所长、历任高能加速器研究机构理事、高能加速器研究机名誉教授（2009年1月为特别荣誉教授）的小林诚，在该机构的贝尔实验数据的支持下，得到2008年的诺贝尔物理学奖。
由以下四大单位所组成：
