鲸豚水族馆是指有饲养鲸鱼或海豚的水族馆，大部分的鲸豚馆将动物饲养在大水池中，少数会将动物圈养在半开放式的海湾或箱网内. 圈养的鲸豚主要训练做为公开的表演活动，或是近距离的与游客互动，及参与学术研究或是军事活动。
鲸鱼海豚从1860s年代开始在北美与欧洲地区被圈养，刚开始是纽约博物馆展示了一对白鲸，而后1938年第一座娱乐用的鲸豚馆在美国佛罗里达圣奥古斯汀成立Marineland of Florida，开始商业娱乐的鲸豚饲养与表演。早期由于对鲸豚的不够了解，与动物福利观念未普及，1960s年代电视系列剧--飞宝的大受欢迎后，鲸豚馆快速的在美国各地扩展，1966年第一只海豚也进入到欧洲圈养。
1972年美国通过海洋哺乳动物保护法案，明订了饲养鲸鱼海豚环境与人员及动物福利的规范，间接造成许多不合标准且难以改善的鲸豚馆关闭。近年来动物权等观念逐渐在世界各地扩展，尤其是英国是一个极致的案例，在1970s年代英国至少仍有36个鲸豚馆，但到了1993年完全关闭。智利与哥斯达黎加也在2005年禁止鲸豚的圈养。 目前全世界仍有63个国家有鲸豚馆 ，最多数量的包含日本57馆，中国44馆，美国34馆，俄罗斯24馆，与墨西哥24馆。
