崔祖思（？－？），字敬元，清河郡东武城县（今河北省衡水市故城县）人。南北朝时期南朝宋及南齐时期官员。祖父崔�是南朝宋的冀州刺史；父亲崔僧护为州秀才。
崔祖思年轻时就很有志向和气魄，又爱读典籍史书，获州府辟为主簿。泰始三年（467年）,北魏军队击败了迎降先前在义嘉之难中叛变的徐兖青冀诸州之的沈攸之及张永大军，辅国将军萧道成时假冠军将军出镇淮阴防备，崔祖思则前去交结道成，当了道成的辅国主簿，并得亲待并参与谋划之事。后历奉朝请、安成王刘准的抚军行参军、员外郎、正员郎及冀州中正等职。萧道成至宋末消灭沈攸之、袁粲等反对他的势力后已完全掌控宋廷朝权，时宋廷正准备封道成为“梁公”，崔祖思却以预言书有言“金刀利刃齐刈之”而请改封齐以应之，道成遂封齐公，祖思任道成的相国从事中郎，后转齐国内史。建元元年（479年），萧道成篡宋建齐，祖思入齐长兼给事黄门侍郎。不久转任宁朔将军、冠军司马，领齐郡太守。同年年末因应北魏有南侵行动而改任冠军将军、军主, 外屯淮上。建元二年（480年）进号征虏将军、军主，后以征虏将军转假节、督青冀二州刺史。祖思在州清廉勤劳，而且谦卑待人，议论也不会触及到敏感时事，遂得萧道成改观器重，但祖思不久就去世了，萧道成还感叹道：“我方欲用祖思，不幸，可惜。”下诏赐三万钱、五十匹布给其家。
