侯伟时（？－1647年9月24日（永历元年八月乙未）），字异度或令邱，荆州府公安县人，明朝、南明政治人物。
侯伟时是崇祯三年（1630年）的举人，次年（1631年）成进士，获授阳江知县，之后曾任职稽勋主事和文选郎中，不热中名利，有好名声。北京沦陷，他的妻子刘氏自缢身亡，自己就易服南走免于遇难。隆武帝继位，起用他为太仆少卿，让他在长沙府征兵。永历帝到奉天，特别擢任他为吏部右侍郎，负责选拔官吏。
孔有德攻陷奉天，永历帝逃亡到靖州，侯伟时不及同行，和吴炳同时被抓获。侯伟时见到孔有德，站立直视，坚持不坐，也不愿薙发和答问，只说：“应死久矣。”如此重复三次。侯伟时只有一子侯章华，时年十岁，很是疼惜。当日清朝命令章华穿着珍服，抱着他的膝盖哭泣请求投降，他却说：“吾生汝如一块土耳！”将章华踢下阶，不停大骂。左右的人都揪着他的脸颊，因此血流满面；刀刃切他的小腿，仆倒在地上，但他仍然不屈服，从容地赋绝命诗而死，路人看到无不哭泣，章华亦忧郁至死。南明朝廷得知他遇害，追赠礼部尚书、东阁大学士，谥号忠靖。
