本列表记述日本各城市的人口排名。
在日本，都道府县与市町村的总人口可分为“推计人口”与“登录人口”两套系统。“推计人口”（常住人口、现住人口）是以国势调查为基础计算的，通过加减每月的出生、死亡、迁入和迁出来计算，包括居住于该地的外国人；日本的国势调查每五年举行一次。“登录人口”则是根据住民基本台账登录的数值，由各市町村自治体每月发布；登录人口包含了进行住民登录的非住民，但并不包括没有登录的居民，因此登录人口未必反映实际的人口数 (例如在乡下地方可能因农村青壮人口外流而户籍人口多于实际人口；在大城市则可能因外来流动人口、黑户、非法移工等原因而实际人口多于户籍人口)。不同的统计方法，人口数据也会差异很大。本文采用的是推计人口。
