纪三井寺站（日语：紀三井寺駅／きみいでらえき */?）是位于和歌山县和歌山市三葛，西日本旅客铁道（JR西日本）的纪势本线（纪国线）车站。
在国铁分割民营化前后的花见季节时，部分特急列车停此站。
在邻站宫前站的下行本线向新宫方向约200m处，设有本州化学专用线分支点(该处上下行本线之间没有渡线，进入本州化学的上行货物列车需要在海南站折返)其专用线的所属车站不是宫前站，而是此站。
车站为地面车站，设有2面2线的相对式月台。在2004年起经设有跨站式站房，设有两边出入口和1处闸口。
车站由和歌山站管理，委托JR西日本MAINTEC（日语：JR西日本メンテック）进行车站业务，为业务委托车站。车站设有1台触控面板式自动售票机。
在未设有跨站式站房前，车站设有1面1线的单式月台和1面2线的岛式月台，共设有2面3线的复合式月台。当时1号月台是御坊方向，3号月台是和歌山方向，很少使用2号月台。随着建设跨站式站房，3号月台被彻走，2号月台成为和歌山方向。车站前后的路段是直线，设有转辙器和绝对信号机，被定义为停留所。类似的修改在关西本线（大和路线）法隆寺站。
以下列出近年1日平均乘车人次。
在车站西边200米（国道42号）处设有医大医院东口巴士站，此站较多巴士路线。
