西拉雅语音系（Siraya phonology）为西拉雅语之音系。而其音系之音位大都使用适当的Unicode符号来标示。在台湾南岛语的书写系统的订定上，元辅音之音系表原则上都是先“发音部位”(横列)、后“发音方法”(纵列)、再考量“清浊音”，来订定其音系之音位架构。
西拉雅语全部使用 26个拉丁字母(A～Z)。
西拉雅语音分元音与辅音。
根据前中研院史语所副所长李壬癸博士与日本语言学家土田兹研究，西拉雅语、大满语及马卡道语等南部平埔语言至少有四种音韵演变的差异及一种构词上的差异：
构词上，西拉雅语表示“未来”的动词后缀为 -ali、-ili（新港社）或 -ati、-ili（卓猴社），而大满语是 -ah（湾里社、麻豆社），马卡道语则是与西拉雅语同源的 -ani（下淡水社）。
整理如下：
-g-
Ø
----
< *S
（表“未来”词缀）
由各地语料上的差异规律，李壬癸发现麻豆社与湾里社有相同的音韵与构词变化，应同属大满语，而非西拉雅语。
李壬癸推论南部平原西拉雅语、大满语及马卡道语约在 3 千多年前就开始分化，只是17 世纪荷兰人据台后，采用台南新港社西拉雅语作为通用语，造成各族群间语言逐渐同化。
其他字汇上的差异如下：
