邹语音系（Cou phonology）为邹语之音系。而其音系之音位大都使用适当的Unicode符号来标示。在台湾南岛语的书写系统的订定上，元辅音之音系表原则上都是先“发音部位”(横列)、后“发音方法”(纵列)、再考量“清浊音”，来订定其音系之音位架构。
邹语正式使用的拉丁字母有22个、含1个二合字母（ng）。母音“ʉ”因输入不便，常以“x”以替之，其余拉丁字母如 d、g、j、q、w 等视情况运用在外来语上。 而清声的声门塞音则以撇号“'”表示，唯在字首时省略。台湾南岛语的书写系统的订定，原则上都是先“发音部位”、后“发音方法”、再考量“清浊音”来订定。
下列子母音表中的音素大都使用适当的Unicode符号来标示。从下表可看出，邹语在喉音、舌根音、舌面音方面小量的退化，而舌尖音、与唇音方面却较广泛的使用。目前邹族各部落每年定期举行的联合祭典中之"近神曲"、"送神曲"等之祭歌，还保留着邹族的古典语音。
在邹语的音素上，比如：字母/l/分别代表北邹的浊齿龈内爆音/ɗ/与南邹舌尖闪音/ɽ/。北邹语中代表舌尖卷舌音/ɽ/的字母/l/，仅出现在久美方言里：达邦和特富野方言并无此音。卡那卡那富邹语和沙阿鲁阿邹语也没有舌尖卷舌音/ɽ/，但有舌尖颤音/r/，故其书写系统亦以/r/字母代表之。沙阿鲁阿邹语中表清齿龈边擦音/ɬ/的字母，仍以/hl/书写。阿里山邹语的半闭前不圆唇元音/e/，卡那卡那富邹语和沙阿鲁阿邹语的中央元音/ǝ/，均以字母/e/表之。邹语的元音长短有辨义的作用，长音的书写方式是将长元音写二次。如：puutu(汉人)/putu(锤子)。
辅音及元音音节表中辅音由/c/至/ '(ʔ)/，元音由/a/至/x(ʉ)/。
